MESS计算速率常数出错

413 · 发表于 Post on 2017-10-31 09:03:05

各位好，有用MESS计算速率常数的吗？有碰到过这个错误的吗？

Lapack::Cholesky::invert: dimensions are different: matrix size = 744 rigt-hand size = 0
terminate called after throwing an instance of 'Error::Range'
Aborted (core dumped)

log文件最后几行内容为:
MasterEquation::low_eigenvalue_method:  starts
   Pressure = 0.01 atm Temperature = 800 K
   collision frequency = 4.57097e+07 1/sec
   MasterEquation::low_eigenvalue_matrix:  starts
      setting up kinetic matrices ... done, cpu time[sec] = 80.31, elapsed time[sec] = 19
      inverting kinetic matrices ...

竹寺 · 发表于 Post on 2023-3-14 15:49:54

MUYI 发表于 2021-9-14 16:32
请问每一种类型的反应是不是都会有一个输入文件啊，然后在此基础上修改。如果不是，那输入文件是怎样产生 ...

大致差不多，选择不同的关键词会有一定的不同

竹寺 · 发表于 Post on 2023-3-14 15:47:22

jing-quan63 发表于 2020-8-17 14:47
您好，能否请教一下，Mess输出文件哪些才是最终的速率常数

输出为两个文件 Log为计算过程 out为反应速率，计算结果同时会输出化学活化反应的速率结果

lm1997 · 发表于 Post on 2022-7-22 20:53:46

413 发表于 2022-7-22 09:28
印象不是很深了
好像没啥本质区别
都是提供坐标信息，频率信息，能垒信息，还有碰撞参数啥的

谢谢老师，我已经解决问题了，是我没仔细按例子，再次感谢您

413 · 发表于 Post on 2022-7-22 09:28:15

lm1997 发表于 2022-7-20 21:56
您好，请问下mess算异构化的过程和算双分子的过程有什么区别呢？（虽然您很久不使用mess但也可能对我的疑惑 ...

印象不是很深了
好像没啥本质区别
都是提供坐标信息，频率信息，能垒信息，还有碰撞参数啥的
要说区别，可能异构化过程会有势垒，双分子反应不一定有势垒

lm1997 · 发表于 Post on 2022-7-20 21:56:27

您好，请问下mess算异构化的过程和算双分子的过程有什么区别呢？（虽然您很久不使用mess但也可能对我的疑惑有所帮助），我在mess手册上没有查到异构化的，他给的例子没有。（详细可看我最新的帖子）

MUYI · 发表于 Post on 2021-9-14 16:32:49

MUYI 发表于 2021-8-30 08:48
好嘞，谢谢！

请问每一种类型的反应是不是都会有一个输入文件啊，然后在此基础上修改。如果不是，那输入文件是怎样产生的呢

MUYI · 发表于 Post on 2021-9-13 14:55:42

发光发表于 2021-8-15 16:02
http://tcg.cse.anl.gov/papr. (2015)
我目前在研究如何安装，同学，如果知道了如何安装运行MESS，还望 ...

你好，请问你成功安装上了吗

MUYI · 发表于 Post on 2021-8-30 08:48:21

发光发表于 2021-8-15 16:02
http://tcg.cse.anl.gov/papr. (2015)
我目前在研究如何安装，同学，如果知道了如何安装运行MESS，还望 ...

好嘞，谢谢！

发光 · 发表于 Post on 2021-8-15 16:02:41

MUYI 发表于 2021-8-11 09:52
请问mess的安装包在哪里可以获得啊

http://tcg.cse.anl.gov/papr. (2015)
我目前在研究如何安装，同学，如果知道了如何安装运行MESS，还望不吝指教！

MUYI · 发表于 Post on 2021-8-11 09:52:42

请问mess的安装包在哪里可以获得啊

jing-quan63 · 发表于 Post on 2020-8-17 14:47:58

doremi 发表于 2020-6-21 09:38
搜索这个网站，上面有详细的安装。https://github.com/PACChem/MESS

您好，能否请教一下，Mess输出文件哪些才是最终的速率常数

doremi · 发表于 Post on 2020-7-22 10:51:49

jing-quan63 发表于 2020-7-8 22:44
谢谢，但是这个网站的教程没法在服务器上正常安装，请问您知道这是为什么吗

你出错的那一步可能是“安装过程中，有一些其它安装包的在线下载”，如果网速过慢，一直下载不下来，确实是会存在你说的安装失败的问题。还有，在安装mess之前，需要先把conda安装好。希望能对你有所帮助。

jing-quan63 · 发表于 Post on 2020-7-8 22:44:01

doremi 发表于 2020-6-21 09:38
搜索这个网站，上面有详细的安装。https://github.com/PACChem/MESS

谢谢，但是这个网站的教程没法在服务器上正常安装，请问您知道这是为什么吗

doremi · 发表于 Post on 2020-6-21 09:38:31

jing-quan63 发表于 2020-6-10 16:40
您好，请问您解决了Mess的安装问题了吗，我也遇到了相同的问题，感谢您的拨冗回复！

搜索这个网站，上面有详细的安装。https://github.com/PACChem/MESS

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[辅助/分析程序] MESS计算速率常数出错