gaussian中非l502,l703等模块运行速度特慢，求助解决（已经解决）

tjchkj

最近遇到一个问题。求大师们指点。版本：gaussian 16 A.03 win64 .
在win7平台下，我用I5 和I7的电脑运行计算，除了l502,l703，l401等这几个模块你还能看到是在做什么，其他各个模块基本上是秒过。

但是在windows 10平台下，双路e5-2696v4.工作站上，完全一样的输入文件，运行后，除了上述几个模块以外，其他的模块都运行很慢才开始下一个，比如我记录下一个过程，
l1，101，l103，l202，l301，l302，l303，l401，l502，l601,l701,l702,l703,l716,l103,l202......等这样后续循环过程。
在I5 和I7这样普通的机器上，这些非502，703等模块，几乎你都看不见一闪就完成了，但这个多路机器上，多数都要运行10多秒甚至一分钟。这是为什么？l502模块支持多核心处理，l703也是可以支持多核心运算。但其他模块似乎就只会用到一个核心。但在那些台式机上，这些模块运行的飞快，几乎都是秒过就完成到下一步这些耗时的模块上了，甚至你连看他是在执行什么模块 都没看清就结束了。说明这些模块处理的非常快。不知道为啥在更强的工作站上就费劲了。
      请有类似相近的双路工作站的且装了windows平台gaussian 16 的老师们，看看是否遇到过同样的问题，问题可能出在什么方面？怎么能解决呢？前提是不要换linux，我也没有linux版的gaussian,也不会linux。恭候各位指点迷津！！！



该问题已经自行研究解决了。谢谢诸位关注！

lanthanum

tjchkj 发表于 2017-12-1 15:23
都是单开gaussian16，都是使用4核心，%CPU=0，1，2，3 内存使用的默认。2696v4花了16分21秒，job cpu tim ...

确实有这个现象，请问楼主怎么解决的？

tjchkj

sobereva 发表于 2017-12-1 12:37
你设的几核并行？有没有和其它i5/i7机子对简单体系对比过windows版运行总耗时？（并行核数相同情况下）
Ga ...

都是单开gaussian16，都是使用4核心，%CPU=0，1，2，3 内存使用的默认。2696v4花了16分21秒，job cpu time 26分52秒。I5 4440 台式机，13分55.6秒，job cpu time 13分57秒。前面那个时间是elapsed time 。可以看出，因为I5机器上，几乎都是看到l502在费时间，其他的都是一闪就算完，基本上10秒就进入502.所以最后的时间里，elapsed time 和job cpu time相差很小。但是在2696v4机器上，整个每个模块都看得到，而且现在内容窗口底部能看到每个模块是干什么的，是在做什么。时间少的也有几秒，多的会几十秒以上到几分钟。进入502模块要好几分钟后才进入。同时看到任务管理器里，只有一个逻辑处理器在100%状态。而用I5或者I7的台式机，这些除去502和703，401等模块，其他的模块都是秒过，你几乎难以看见哪个模块在干什么，就是换到502，703或者401（mo）了。
另外因为I5 4440主频比2696v4高，CPU主频：3.1GHz  ，最大睿频：3.3GHz   ，所以如果用同样的cpu去算一个东西，肯定是I5的快，这样看I5比2696v4快相差2分多钟是正常的。在2696v4上我使用shared=40来计算，结果是 job cpu time 15分，elapsed time 是4分37秒。所以主要是这些非l502模块在2696v4这里耽误了时间，我会在另外一个帖子里分析一下所谓的并行效率问题。目前这个非l502模块处理慢肯定是不正常的了。我必须先去处理下，否则机器就废了。
  关于你说的windows gaussian处理输出的结果到GUI界面的那个延迟，因为在同样平台里的I5 I7机器里都不会有延迟，所以这里也不会有，因为我在这些I5I7机器上都计算了不下几千次了，买这个机器是针对10万个计算量级才要用的。因为任务体系都不大，所以一个任务在I5机器跑3小时吧，所以已经做了很多，只有在2696v4这个机器上，才突然发现，以前在台式机上根本看不到的模块居然这么缓慢，以前那些模块都是秒过，没来得及看清就过去了。

sobereva

你设的几核并行？有没有和其它i5/i7机子对简单体系对比过windows版运行总耗时？（并行核数相同情况下）
Gaussian Windows版在把输出文件里的信息输出到GUI界面的时候往往有明显延迟，可能你看似很慢，但实际耗时并没问题。

tjchkj

而且用asda测试稳定性的时候，温度时间图卡住没法看变化，说明系统有问题。换成win7试试了。