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[新手求助] IRC只能向一边跑,如何解决?

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对过渡态进行IRC验证,结果IRC只能跑一半,无论加reverse还是forward都不行?请问该如何解决?

1111.jpg (50.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 74)

1111.jpg

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发表于 Post on 2022-1-22 11:02:46 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-12-12 15:20
服务器好牛逼,用CCSD走IRC

你好,请问您用ccsd做IRC的输入文件怎么写的呢?我先做了半数值的freq, 然后读取chk,readfc,还是没算就报错了,您可以分享一下您的输入文件吗?我的输入文件如下
%chk=r3-ts-irc-test
%nprocshared=8
%mem=16gb
# ccsd(maxcycle=500)/aug-cc-pvtz freq

freq

0 1
O                  0.05120100    1.24334900    0.00000000
H                  0.06339300    0.07509000    0.00000000
O                  0.05120100   -1.08448300    0.00000000
H                 -0.88260300   -1.34602500    0.00000000

--Link1--
%chk=r3-ts-irc-test
# CCSD/aug-cc-pVtZ Geom=Check Guess=Read IRC=(Maxpoints=40,readFC,lqa)

irc

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发表于 Post on 2020-11-30 09:27:36 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

楼主,请问这个问题解决了吗?

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发表于 Post on 2019-4-28 04:25:19 | 只看该作者 Only view this author
自制奶酪 发表于 2019-4-27 14:39
你好。我对过渡态做IRC验证的时候也是只跑出一半,请问你怎么解决的呢,能告诉我一下吗

这里说得极为清楚
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2019-4-27 14:39:40 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

你好。我对过渡态做IRC验证的时候也是只跑出一半,请问你怎么解决的呢,能告诉我一下吗

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发表于 Post on 2018-4-9 02:34:54 | 只看该作者 Only view this author
lijiayisjtu 发表于 2018-4-8 14:23
应该不是计算方法和基组的问题,想问下您,这问题后来是怎么解决的,IRC 只跑了一半

在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400
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发表于 Post on 2018-4-8 14:23:34 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

应该不是计算方法和基组的问题,想问下您,这问题后来是怎么解决的,IRC 只跑了一半
Shanghai JiaoTong University
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-14 19:49:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-14 16:35
步长比默认增大一倍看看
其实用双杂化怎么也够了,此时用calcfc、recalc都方便

我用CCSD跑的irc,加calcfc的话没有解析二阶倒数。目前我用的是rcfc

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发表于 Post on 2017-12-14 16:35:08 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2017-12-14 08:13
sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。


步长比默认增大一倍看看
其实用双杂化怎么也够了,此时用calcfc、recalc都方便
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-14 08:13:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-12 20:02
优化过渡态时用tight收敛限,之后走IRC再试
步长不可能增加到200,绝对死掉。适当增大步长有可能解决当前 ...

sob老师,用tight重新计算了过渡态,再跑irc仍然只有一半。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-13 20:38:10 | 只看该作者 Only view this author
lip 发表于 2017-12-13 15:54
这一个问题Sob老师之前也解释过,可以在站内搜索一下。

看你的问题应该是过渡态位置不正确,找到的不是s ...

过渡态振动模式正确,通过其他方法基组已经优化出TS并且进行了IRC的验证,现在换成CCSD方法重新进行计算,TS也优化出来,且振动模式正确,但就是IRC前半部分跑不出来

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发表于 Post on 2017-12-13 15:54:24 | 只看该作者 Only view this author
这一个问题Sob老师之前也解释过,可以在站内搜索一下。

看你的问题应该是过渡态位置不正确,找到的不是s=0的位置,而是在“坡”上。
先检查过渡态振动模式是否正确,在看虚频大小是否合适

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发表于 Post on 2017-12-12 21:50:00 | 只看该作者 Only view this author
xylz6188 发表于 2017-12-12 21:26
谢谢sobereva老师!我试一试。另外前次在群里请教你计算偶极矩的方法,你推荐用b3lyp/Def2-QZVPD。我用这 ...

我推荐的是def2-TZVPD。没必要QZ
算反应机理用def2-TZVP就已经足够了,不要加D,也不要用QZ,否则白费时间。
你当前的问题不是基组的事
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发表于 Post on 2017-12-12 21:26:45 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sobereva老师!我试一试。另外前次在群里请教你计算偶极矩的方法,你推荐用b3lyp/Def2-QZVPD。我用这个方法和基组来做反应机理,优化反应复合物,最后变成产物了,过渡态有很多虚频,这是怎么回事sobereva老师,再次请教一下!
越努力越幸运!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-12 21:23:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-12 20:02
优化过渡态时用tight收敛限,之后走IRC再试
步长不可能增加到200,绝对死掉。适当增大步长有可能解决当前 ...

谢谢sob老师!
过渡态我用tight重新计算一下,再跑IRC看看结果。
步长增加到200果断死掉

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