对称的分子，自己计算的homo的分布和文章的对应不起来

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-5 21:35:32

为了计算实验上的分子，是一种D-A-D类型的，两边是相同的。之前的帖子http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=894&extra= 我咨询过，但是没有解决。
我在表述一下我的意思。
我计算实验的分子，计算的homo是分布在一边的donor上，如图。但是，实验是在两个d上。我换了分子结构计算了好几次了，都是在一个d上，不知道为什么，求指点。

cccxq · 发表于 Post on 2024-9-29 10:25:45

老师，我想问问我用MS 算出来HOMO和LUMO中Cl原子没有贡献，但是DOS中Cl原子贡献很高，这种情况正常吗

jlx_ · 发表于 Post on 2015-4-27 12:14:16

小范范1989 发表于 2015-4-27 11:40
1：homo是最高占据轨道，分子轨道理论。
2：donor是我们所说的基团，比如所供电子基团就叫做donor，吸电 ...

对了，还要问一下您，HOMO-LUMO一般是负值还是正数？我看了一篇文章（Experimental and density functional studies on the corrosion behavior of the copper-nickel-tin alloy），他的结果是正数，但是我按照他的参数算出来的全是负数...

jlx_ · 发表于 Post on 2015-4-27 11:48:13

小范范1989 发表于 2015-4-27 11:40
1：homo是最高占据轨道，分子轨道理论。
2：donor是我们所说的基团，比如所供电子基团就叫做donor，吸电 ...

恩恩，明白了，就是说看这个图的时候，谁上面的面积大，谁的电荷就多，容易给电子。但是不是很明白的是这个HOMO donor和Fukui（+）怎么扯上关系了？Fukui图和HOMO分布图一样？

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-27 11:40:20

jlx_ 发表于 2015-4-27 11:31
弱弱的问下楼主，HOMO的donor是什么？有什么用？

1：homo是最高占据轨道，分子轨道理论。
2：donor是我们所说的基团，比如所供电子基团就叫做donor，吸电子基团就叫acceptor。当然这个吸电子和供电子基团不是固定不变的，要分情况看。
3：两个的联系，分子在激发的时候，如果是CT态这样的分子，一般都是电子从donor转移到acceptor上。hom一般分布在donor。lumo一般分布在acceptor上
4：我理解的不是很多，错误之处还请指正

jlx_ · 发表于 Post on 2015-4-27 11:31:55

弱弱的问下楼主，HOMO的donor是什么？有什么用？

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-25 08:17:22

卡开发发发表于 2015-4-24 21:56
已在Gaussview重新指定为Cs的点群了。
已测试，HOMO对称。

谢谢你，还麻烦你都测试了，谢谢你的关注，更谢谢你的帮助。祝好。

卡开发发 · 发表于 Post on 2015-4-24 21:56:19

本帖最后由卡开发发于 2015-4-24 23:04 编辑

小范范1989 发表于 2015-4-13 22:15
谢谢您，让您费心了，

已在Gaussview重新指定为Cs的点群了。
已测试，HOMO对称。

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-13 22:15:29

卡开发发发表于 2015-4-13 22:14
这样我就很难说得清什么原因了，以往这样的问题我都是自己check过再给出结果的，最近忙了点，等有时间我 ...

谢谢您，让您费心了，

卡开发发 · 发表于 Post on 2015-4-13 22:14:26

小范范1989 发表于 2015-4-13 20:12
卡开发发，你好，当时您给的分子，我计算了，算出来的homo还是在一个D上。可能是由于分子对称性的问题没 ...

这样我就很难说得清什么原因了，以往这样的问题我都是自己check过再给出结果的，最近忙了点，等有时间我也亲自做计算测试一下试试。

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-13 20:12:53

卡开发发发表于 2015-4-7 00:42
试试看这个gjf，如果还不行我就没啥办法了。

卡开发发，你好，当时您给的分子，我计算了，算出来的homo还是在一个D上。可能是由于分子对称性的问题没弄好。这次来参加sob的培训班了，所以回复的您比较晚，不好意思。我问了问sob，我想在使用gview按照对称性来重新画分子。等我明天培训结束，后天回学校，我再计算一下。麻烦您了。谢谢您

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-7 10:20:52

卡开发发发表于 2015-4-7 00:42
试试看这个gjf，如果还不行我就没啥办法了。

谢谢您，给您添麻烦了。我先算算试试，等成功的话，我再通知您。谢谢。

卡开发发 · 发表于 Post on 2015-4-7 00:42:50

小范范1989 发表于 2015-4-6 22:48
谢谢您，我刚刚回宿舍才看到，麻烦您了。

试试看这个gjf，如果还不行我就没啥办法了。

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-4-6 22:48:04

卡开发发发表于 2015-4-6 22:43
1、指的是不通过Ab initio或DFT而是通过Force filed如amber或uff；
2、materials studio同样提供了力场 ...

谢谢您，我刚刚回宿舍才看到，麻烦您了。

卡开发发 · 发表于 Post on 2015-4-6 22:43:12

小范范1989 发表于 2015-4-6 22:05
谢谢你，又见到你了，小木虫上也关注你了。谢谢你的指点。
1：不太理解你说的加力场优化，就是高斯优化 ...

1、指的是不通过Ab initio或DFT而是通过Force filed如amber或uff；
2、materials studio同样提供了力场以及DFT的计算（精度不及Gaussian因处理面向的对象及受众人群稍有差异），当然核心问题是为了找对称性，不得不说MS在建模方面比Gaussian来的更方便；
3、在此方面，MS更大的优点就是以较低的标准可以找对称性（如即便结构稍存在偏差，也可放宽条件找出对称性），之后程序可以按照这个对称性对结构微调。上述问题是下午在学校弄得，晚点我自己生成一份你拿去算一下看看；
4、如果真的是Cs的话电子态本身也应该对称或反对称；
5、同样希望一块儿交流，最好大家一块儿来讨论。

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[Gaussian/gview] 对称的分子，自己计算的homo的分布和文章的对应不起来

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