计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13726|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 金属腐蚀的分子动力学模拟

[复制链接 Copy URL]

393

帖子

1

威望

5145

eV
积分
5558

Level 6 (一方通行)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本人一直用Gaussian计算一些有机分子的作用,现在想研究一下不同离子水溶液条件下,对零价金属的腐蚀的影响。考察了Materials Studio和Lammps两款软件,发现多数文章都是计算某一分子在金属表面的吸附能 或者 合金相内扩散等问题,几乎没有找到任何关于:金属-氧化-对应的金属离子释放的过程。
个人猜测是分子动力学不能模拟有价态变化的相变过程:Metal0(solid)-Metal cation(aq)
请问一下大家能否推荐能够胜任此工作的MD软件,或者如果把体系压缩到足够小(300原子以内),高斯能不能计算这个过程?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-9-2 07:04:00 | 只看该作者 Only view this author
一条君 发表于 2024-8-31 22:51
老师,不太明白明确知道金属A和分子B反应,把问题简化到一个金属原子和一个分子用高斯算为什么不行,丝毫 ...

当近似表现金属表面用的原子簇的尺寸不够大的时候,边界效应都会很明显而无法接受,更谈何就一个金属原子了,其特征和金属表面有天壤之别(除非机理就是固体表面上负载的单原子与分子的反应,某些情况下就考虑一个金属原子可能还勉强说得通)。常用的合理的簇模型可以参考下文。不合理的计算模型就算得到了期望的结果也毫无意义。

使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

191

帖子

0

威望

1098

eV
积分
1289

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2024-8-31 22:51:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 一条君 于 2024-8-31 22:58 编辑
sobereva 发表于 2018-4-14 02:44
价态变化没法靠一般的分子动力学模拟手段来体现
得用从头算动力学,但是对于你的体系尺寸,是肯定算不动的

老师,不太明白明确知道金属A和分子B反应,把问题简化到一个金属原子和一个分子用高斯算为什么不行,丝毫看不到断键,(1)请问是因为反应涉及到动力学(势垒?)吗(和楼主问题类似),(2)那为什么一些简单的反应用高斯又能看到键的变化呢(因为动力学很容易?),谢谢~
科音学员

3809

帖子

3

威望

1万

eV
积分
20335

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

4#
发表于 Post on 2018-4-14 06:19:57 | 只看该作者 Only view this author
1、价态变化,成键断键的过程一般的分子力场处理不了,从头算动力学的计算量有相当大。
2、金属腐蚀在电化学中被解释为电极过程,一般认为,金属表面不同区域的性质稍有差异从而导致不同的性质在电化学过程分别形成阴极区和阳极区而各自发生阴阳极反应,所以模拟会把阴阳极拆成两个过程来做,你可以参考Matthew Neurock的处理手段。

评分 Rate

参与人数
Participants 2
eV +6 收起 理由
Reason
kunkun + 5 头像不错
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

269

帖子

1

威望

3030

eV
积分
3319

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2018-4-14 06:02:59 | 只看该作者 Only view this author
动力学估计没戏了,找几条可能的反应路径或许可行

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-4-14 02:44:59 | 只看该作者 Only view this author
价态变化没法靠一般的分子动力学模拟手段来体现
得用从头算动力学,但是对于你的体系尺寸,是肯定算不动的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 12:05 , Processed in 0.168944 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list