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[新手求助] 在计算S0→T1的重组能遇到一些问题

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本帖最后由 胖嘟嘟123 于 2018-4-27 09:21 编辑

老师,您好,我是一个在量化方面的新手,有一些基础的问题想要咨询您,在之前我看到了您写的关于重组能计算的文章,在第二部分中S0→T1的重组能计算,对E3的计算不是很明白,以下为我的理解,希望老师帮忙指正:
                                                                                      E1的能量为S0结构优化好的计算单点能;
                                                                                      E2的能量为S0结构垂直激发的能量,在E1的输入文件中加入TD(triplet,root=1,nstates=10)输出文件为所得E2;
                                                                                      E4的能量为0 3优化后的T1结构计算单点能;
老师,请问以上我的这个理解对吗?但是E3的输入文件应该怎么写呢?怎么计算这一部分的重组能呢?若说得有不对的地方,请您见谅,谢谢老师。

20160531072805_55914.png (39.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 73)

摘自之前老师文章的图

摘自之前老师文章的图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-20 15:26:27 | 只看该作者 Only view this author
貌美如花小吒吒 发表于 2019-5-28 08:35
你好,可以请问一下,这两个数分别改成多少了呢?我改了好几个数有的还是出现这个错误。而且,改动这两个 ...

改成1 2,因为体系不同处理方式也不同,你可以试一下改过之后能不能算出来

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发表于 Post on 2019-5-29 08:38:14 | 只看该作者 Only view this author
柒月小鱼 发表于 2019-5-28 22:23
是有过渡金属么
用新版本自己编译试试?

你好,没有过渡金属,计算的是中性分子和阳离子之间的空穴重组能。我再去尝试一下,谢谢。

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发表于 Post on 2019-5-28 22:23:07 | 只看该作者 Only view this author
貌美如花小吒吒 发表于 2019-5-28 08:35
你好,可以请问一下,这两个数分别改成多少了呢?我改了好几个数有的还是出现这个错误。而且,改动这两个 ...

是有过渡金属么
用新版本自己编译试试?

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发表于 Post on 2019-5-28 08:35:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 貌美如花小吒吒 于 2019-5-28 21:01 编辑
胖嘟嘟123 发表于 2018-4-30 14:18
老师,我已经解决这个问题了,把第一行的两个数字改一下就可以了

你好,可以请问一下,这两个数分别改成多少了呢?我改了好几个数有的还是出现这个错误。而且,改动这两个数后输出结果也不相同。

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发表于 Post on 2018-5-2 21:13:07 | 只看该作者 Only view this author
胖嘟嘟123 发表于 2018-5-2 09:00
您好,还有一个问题想要请教,在做重组能与振动模式的图中,我看到sob开始的博文里写要整理数据,请问是 ...

仔细读Sob的博文了。  
那个不是我写的, 我不清楚。

或者来办公室找我,我在你对面。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-2 09:00:02 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2018-5-1 23:06
也许你的方案中,可能用不到DUSHIN这种处理方案。

您好,还有一个问题想要请教,在做重组能与振动模式的图中,我看到sob开始的博文里写要整理数据,请问是输出文件中的哪部分数据,我没有太看明白,请您指导一下。万分感谢

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发表于 Post on 2018-5-1 23:06:13 | 只看该作者 Only view this author
也许你的方案中,可能用不到DUSHIN这种处理方案。

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发表于 Post on 2018-4-30 22:05:12 | 只看该作者 Only view this author
胖嘟嘟123 发表于 2018-4-30 14:18
老师,我已经解决这个问题了,把第一行的两个数字改一下就可以了

If anything is impossible? It should be done!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-30 14:18:39 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-4-30 13:12
这个问题我还真不清楚,你可以把你的输入文件上传下,看看论坛的大牛能不能帮你解决

老师,我已经解决这个问题了,把第一行的两个数字改一下就可以了

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发表于 Post on 2018-4-30 13:12:51 | 只看该作者 Only view this author
胖嘟嘟123 发表于 2018-4-29 21:44
老师,还得打扰您一下,请问输出这个是什么原因呢?我的体系之前算的两个都没有这个情况,这个是什么错 ...

这个问题我还真不清楚,你可以把你的输入文件上传下,看看论坛的大牛能不能帮你解决
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-29 21:44:48 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-4-29 05:41
有这种可能性,用sed命令把16换成09试一下

老师,还得打扰您一下,请问输出这个是什么原因呢?我的体系之前算的两个都没有这个情况,这个是什么错误呢?
UNMAPPED #2 atom            1          77
TRYING LOCATION ONLY--- READ IN ORDER
forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 5, file /home/rd14/G16-dushin/dushin_v0.2018/bin/dushin.dat
Image              PC                Routine            Line        Source            
dushin             0000000000452646  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             0000000000475147  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             00000000004733A5  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             0000000000430B8B  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             000000000040411D  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             000000000040302E  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003A8381ED1D  Unknown               Unknown  Unknown
dushin             0000000000402F39  Unknown               Unknown  Unknown

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-29 14:54:59 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-4-29 05:41
有这种可能性,用sed命令把16换成09试一下

老师,问题解决啦,谢谢老师

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发表于 Post on 2018-4-29 05:41:34 | 只看该作者 Only view this author
胖嘟嘟123 发表于 2018-4-28 15:24
老师,dushin是不支持gaussian16吗?

有这种可能性,用sed命令把16换成09试一下
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-28 15:24:04 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2018-4-28 08:35
在计算时采用的何种泛函呢,dushin可能不识别某些泛函,因此需要手动把泛函调整下,比如修改成b3lyp

老师,dushin是不支持gaussian16吗?

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