高斯计算硬盘配置选择

xaomidaxue · 发表于 Post on 2018-6-20 08:43:13

现有几台服务器需要组成集群，但是在硬盘上面的选择有以下几种考虑：
1、全部用SSD，主节点上用5块480G的SSD组成raid5；计算节点全部用480G的SSD。
2、主节点用SAS 600g 10K的盘，5块SAS组成raid5；计算节点采用SAS 600G
3、主节点采用SSD+SAS盘（SSD做计算，SAS做存储）；计算节点采用SAS 600G或者SSD 480G。
另外，SSD的采用MLC还是TLC的颗粒，MLC的颗粒好像要贵不少。
上面的配置主要考虑点是在性价比的基础上获得一定的数据稳定性。
主要用于计算Gaussian和MS软件。考虑到SAS盘的成本较高，也考虑过SATA的盘，但是好像效果不是很好。
虽然sober老师说过SAS和SSD对于计算速度没有影响，但是两者的稳定性是不一致的。

还望老师指点一下，谢谢！

bluewhale · 发表于 Post on 2018-6-20 11:32:58

配SSD, 不如配SATA, 加内存！
如是Linux，作一链接：
ln -s /dev/shm /scratchmem
对于绝大部分任务，都在内存中完成，少量的任务可能会用到普通的/scratch。

sobereva · 发表于 Post on 2018-6-20 12:17:33

对于计算速度不是没有影响，看算什么，如果是以DFT为主，那不用管硬盘速度
SAS我认为没有用的必要。机械的用企业级SATA就够了。

xaomidaxue · 发表于 Post on 2018-6-20 12:49:53

sobereva 发表于 2018-6-20 12:17
对于计算速度不是没有影响，看算什么，如果是以DFT为主，那不用管硬盘速度
SAS我认为没有用的必要。机械的 ...

谢谢sober老师，明白了。

xaomidaxue · 发表于 Post on 2018-6-20 17:03:34

bluewhale 发表于 2018-6-20 11:32
配SSD, 不如配SATA, 加内存！
如是Linux，作一链接：
ln -s /dev/shm /scratchmem

请问，这个连接需要写入bashrc么。还是写入pbs脚本就行。
谢谢

一颗赛艇 · 发表于 Post on 2018-6-21 05:32:55

有能力上ZFS raid，这样磁盘阵列可靠性更高

bluewhale · 发表于 Post on 2018-6-21 10:08:05

xaomidaxue 发表于 2018-6-20 17:03
请问，这个连接需要写入bashrc么。还是写入pbs脚本就行。
谢谢

在各计算节点以root操作一次即可，容量最多为内存的一半。

Jasminer · 发表于 Post on 2018-6-21 20:52:32

做postHF的话，计算节点用SSD，否则用企业级SATA即可。
主节点配SSD装系统和日常使用，SATA组RAID10做存储，而且RAID10可靠性很高，用家用硬盘都可以，容量优先，但最好搞个硬RAID卡，软RAID有时莫名其妙的CPU占用率非常高。

bluewhale · 发表于 Post on 2018-6-21 21:11:29

RAID10容量对折，我们这里一般用Raid 5 + 备盘的方式。

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