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[配置讨论] 高斯计算硬盘配置选择

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发表于 2018-6-20 08:43:13 | 显示全部楼层 |阅读模式
现有几台服务器需要组成集群,但是在硬盘上面的选择有以下几种考虑:
1、全部用SSD,主节点上用5块480G的SSD组成raid5;计算节点全部用480G的SSD。
2、主节点用SAS 600g 10K的盘,5块SAS组成raid5;计算节点采用SAS 600G
3、主节点采用SSD+SAS盘(SSD做计算,SAS做存储);计算节点采用SAS 600G或者SSD 480G。
另外,SSD的采用MLC还是TLC的颗粒,MLC的颗粒好像要贵不少。
上面的配置主要考虑点是在性价比的基础上获得一定的数据稳定性。
主要用于计算Gaussian和MS软件。考虑到SAS盘的成本较高,也考虑过SATA的盘,但是好像效果不是很好。
虽然sober老师说过SAS和SSD对于计算速度没有影响,但是两者的稳定性是不一致的。

还望老师指点一下,谢谢!

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发表于 2018-6-20 11:32:58 | 显示全部楼层
配SSD, 不如配SATA, 加内存!
如是Linux, 作一链接:
ln -s  /dev/shm /scratchmem
对于绝大部分任务,都在内存中完成,少量的任务可能会用到普通的/scratch。

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发表于 2018-6-20 12:17:33 | 显示全部楼层
对于计算速度不是没有影响,看算什么,如果是以DFT为主,那不用管硬盘速度
SAS我认为没有用的必要。机械的用企业级SATA就够了。
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 楼主| 发表于 2018-6-20 12:49:53 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-6-20 12:17
对于计算速度不是没有影响,看算什么,如果是以DFT为主,那不用管硬盘速度
SAS我认为没有用的必要。机械的 ...

谢谢sober老师,明白了。

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 楼主| 发表于 2018-6-20 17:03:34 | 显示全部楼层
bluewhale 发表于 2018-6-20 11:32
配SSD, 不如配SATA, 加内存!
如是Linux, 作一链接:
ln -s  /dev/shm /scratchmem

请问,这个连接需要写入bashrc么。还是写入pbs脚本就行。
谢谢

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发表于 2018-6-21 05:32:55 | 显示全部楼层
有能力上ZFS raid,这样磁盘阵列可靠性更高

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发表于 2018-6-21 10:08:05 | 显示全部楼层
xaomidaxue 发表于 2018-6-20 17:03
请问,这个连接需要写入bashrc么。还是写入pbs脚本就行。
谢谢

在各计算节点以root操作一次即可,容量最多为内存的一半。

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发表于 2018-6-21 20:52:32 | 显示全部楼层
做postHF的话,计算节点用SSD,否则用企业级SATA即可。
主节点配SSD装系统和日常使用,SATA组RAID10做存储,而且RAID10可靠性很高,用家用硬盘都可以,容量优先,但最好搞个硬RAID卡,软RAID有时莫名其妙的CPU占用率非常高。

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发表于 2018-6-21 21:11:29 | 显示全部楼层
RAID10容量对折,我们这里一般用Raid 5 + 备盘的方式。
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