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[新手求助] 一次性执行当前目录下所有ORCA输入文件失败求助

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楼主
本帖最后由 Novice 于 2022-12-19 16:27 编辑

我根据社长使用Gaussian时的几个实用脚本和命令 http://sobereva.com/258”一文修改了一次性执行当前目录下所有Gaussian输入文件的脚本,以使其成为一次性执行当前目录下所有orca输入文件的脚本,修改后如下:
#!/bin/bash
for inf in *.inp
do
echo Running ${inf} ...
time orca ${inf} > ${inf//inp/out}
echo ${inf} is finished
echo
done

运行后发现只有CPU的一个核心在进行orca的工作,而且产生out文件为空,没有产生orca正常运行时的一些临时文件,(P.S. 直接orca *.inp > *.out 运行正常,输入文件没有问题),求助各位哪里出错了?

-------------------
以下应为可正常执行的代码(代码中红色部分请如实修改为你自己的Orca实际所在目录):
-------------------

#!/bin/bash
for inf in *.inp
do
echo Running ${inf} ...
time /你的Orca安装目录/orca ${inf} > ${inf//inp/out}
echo ${inf} is finished
echo
done




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发表于 Post on 2019-5-20 16:05:04 | 只看该作者 Only view this author
你的问题解决了没

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-20 18:08:33 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2019-5-20 16:05
你的问题解决了没

没解决,好像ORCA不支持这么操作,我觉得可以尝试一下将脚本中的orca改为orca的绝对路径可能会有效,但不保证,你可以试一下

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发表于 Post on 2019-5-20 22:25:13 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2019-5-20 18:08
没解决,好像ORCA不支持这么操作,我觉得可以尝试一下将脚本中的orca改为orca的绝对路径可能会有效,但不 ...

我试了也是提示要绝对路径,不知道改了行不,明天试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-21 09:06:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Novice 于 2020-9-3 01:11 编辑
biogon 发表于 2019-5-20 22:25
我试了也是提示要绝对路径,不知道改了行不,明天试试

亲测将orca改为使用orca绝对路径有效。

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发表于 Post on 2022-12-15 22:35:05 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2019-5-21 09:06
亲测将orca改为使用orca绝对路径有效。

能贴出一下修改后的代码吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-19 16:26:18 | 只看该作者 Only view this author
PoorChaos 发表于 2022-12-15 22:35
能贴出一下修改后的代码吗

修改了原帖,请见楼上。

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发表于 Post on 2022-12-20 19:19:12 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2022-12-19 16:26
修改了原帖,请见楼上。

谢谢!

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