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[文献推荐] 9评EDA

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https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jcc.26003

Nine questions on energy decomposition analysis

eda之乱象
有兴趣的可以看看
B样条插值
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发表于 Post on 2019-6-30 12:16:29 | 只看该作者 Only view this author
Mark. 好多大牛。怎么没看到Tom Ziegler? 可惜Morokuma离开早了,不然可以听听他的见解。

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发表于 Post on 2019-6-30 14:12:22 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
这题目取的 真牛瓣

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埋進雨裡聽海的呼吸

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发表于 Post on 2019-6-30 14:50:22 | 只看该作者 Only view this author
这样来看把论坛里前辈们的优秀回答整理一下也可以发表,发现了发文章的好途径
奔跑吧 驕傲的少年

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发表于 Post on 2019-6-30 16:08:37 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-6-30 12:16
Mark. 好多大牛。怎么没看到Tom Ziegler? 可惜Morokuma离开早了,不然可以听听他的见解。

Ziegler已故
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2019-6-30 16:09:30 | 只看该作者 Only view this author
chrinide 发表于 2019-6-30 14:12
这题目取的 真牛瓣

也有类似的文章,比如Computational and Theoretical Chemistry 1053 (2015) 2–16
标题Six questions on topology in theoretical chemistry,也是一大堆作者各种侃
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-7-1 13:11:37 | 只看该作者 Only view this author
从发言长短来看,感觉某位教授只会嗯啊着是

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发表于 Post on 2019-7-2 17:04:53 | 只看该作者 Only view this author
看了几页,有些非native speakers还存在一些语法错误,看来应该是未经编辑润色的原话。

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发表于 Post on 2019-7-27 22:51:41 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2019-7-1 13:11
从发言长短来看,感觉某位教授只会嗯啊着是

没觉得啊

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发表于 Post on 2019-7-27 23:25:59 | 只看该作者 Only view this author
终于用碎片时间拖拖拉拉地看完了。基本上窥得各大门派的见解和争论吧。纯从个人情感上看(虽然对待科学问题不应该这样),灰常灰常灰常反感最后一对儿contributors:不管什么问题,都拿出一副“SAPT老子天下第一”的态度。所有人都在比较和讨论各种不同的EDA的优劣,而他们则自始至终都只得巴SAPT,一大段一大段地营销他们的SAPT。对“是否能找到一种终极统一的EDA方案”的问题,其他所有人都持非常保留或审慎态度,唯独他们却号称,不用找了,SAPT就是EDA的终极理论。

比较尖锐的反对主流EDA的声音来自Weinhold,他还是指出所有基于轨道的主流EDA的“死穴”——在轨道没正交化的提前下,所有在Hilbert空间中把分子切为原子的方法都是在耍流氓,因为这必然会引起类型Mulliken布局那样的武断划分原子间的overlap。 Weinhold祭出的另一“挑衅”是:敢问哪个EDA能够像他们那篇文章(https://doi.org/10.1080/00268976.2012.661478)中那样地给出氢键的操作性定义?

我又特意去读了Weinhold提的那篇文章,里面利用统计相关性研究解释了氢键的给体-受体本质(但他们用于描述静电本质的偶极-偶极作用模型,我持怀疑和保留态度)。同时,我发现他在文中狠狠地怼了Stone之前关于氢键的静电本质的看法——也许这是后来他们之间来回怼的导火索吧? (参见:Scientists wrangle over disagreement between charge transfer measurements

总之,EDA方案很多,也有不同的分类标准。有人甚至认为EDA不能称为理论,只能称作工具,“没有是非对错之别,只有有用无用之分”。能量分解的各项一般都为实验不可测量的物理量,因此无法证伪。绝大多数人认为即使存在终极的EDA方案,其路也还挺修长的。 本论坛对主流EDA和SAPT也出现过一些不同声音,如http://bbs.keinsci.com/thread-9456-1-1.html

纯属个人读后感,欢迎讨论。

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发表于 Post on 2019-7-28 04:22:36 | 只看该作者 Only view this author
对于弱相互作用范畴,SAPT是最理想的能量分解形式,基本上已成公认。这文章我还没看,不过如果SAPT的人只是强调对于弱相互作用范畴SAPT多么多么好,那么底气倒是足够足。SAPT精度高,在色散部分作用上很严格,结果的物理意义也很强,符合一般化学直觉,而且有免费程序PSI4可以很方便地做,最低阶的SAPT0算大体系也不费劲。
相对而言,化学键范畴的EDA选择和争论余地更大。
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发表于 Post on 2019-7-28 08:20:12 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 beefly 于 2019-7-28 08:21 编辑

对于X-H...pi这类氢键体系,如果X是氧族、卤素,所有的EDA(包括SAPT)都没问题。但是如果X是氮,除了个别体系外,大部分情况下EDA都不会认为这是氢键。如果X是碳、硼、磷,EDA认为这些都不是氢键。但是,其中有些体系在实验者看来仍然属于氢键,而且他们也有各种实验上的证据。我也不知道谁对。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-28 14:39:19 | 只看该作者 Only view this author
最近发展很快的一家EDA是head-gordon的 ALMO-EDA
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发表于 Post on 2019-7-28 17:50:03 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-28 04:22
对于弱相互作用范畴,SAPT是最理想的能量分解形式,基本上已成公认。这文章我还没看,不过如果SAPT的人只是 ...

对于较强的化学成键作用,已经不能用微扰来近似了吧

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发表于 Post on 2019-7-28 18:41:43 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-7-28 17:50
对于较强的化学成键作用,已经不能用微扰来近似了吧

如果是典型化学键,不适合SAPT
如果是很强弱相互作用,都已经有一定共价成分了,用SAPT还是可以的,只不过共价作用被等效通过“极化”项体现了出来
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