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[VASP] VASP算完IR该如何处理得到谱图?

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本帖最后由 菜鸡互啄 于 2019-11-18 18:07 编辑

各位老师好,

    最近使用VASP计算了材料的IR,通过脚本可以得到峰的位置和相对强度:001 3556.5 1.000像这种,但是我想画成有宽度的峰,请问该如何处理才能得到红外谱图呢?我想画成图跟实验结果对比。请各位老师指点迷津,非常感谢!

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发表于 Post on 2019-11-18 12:36:45 | 只看该作者 Only view this author
不是很理解你的意思,用脚本得到了位置和强度不就是红外谱图吗? 还是说你得到是一条一条的线,但想画成有一定宽度的峰?是的话你可以用高斯或者洛伦兹展宽。如果你跑的AIMD,谱本身就是展宽的了,可以直接和实验比对。

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发表于 Post on 2019-11-18 15:02:59 | 只看该作者 Only view this author
有一个后处理的shell脚本,可以得到频率对应的强度。可以先找找

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-18 17:56:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 菜鸡互啄 于 2019-11-18 18:15 编辑
dummy1 发表于 2019-11-18 12:36
不是很理解你的意思,用脚本得到了位置和强度不就是红外谱图吗? 还是说你得到是一条一条的线,但想画成有一 ...

我用脚本得到的是一个峰位置和一个相对强度值:001 3556.5 1.000这种,但是我想画成有一定宽度的峰。是不用脚本就可以从某个文件中读出谱图吗?我的计算和后处理方法是从这里学到的https://homepage.univie.ac.at/david.karhanek/downloads.html#Entry02

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-18 17:59:47 | 只看该作者 Only view this author
ORCA_in_TCC 发表于 2019-11-18 15:02
有一个后处理的shell脚本,可以得到频率对应的强度。可以先找找

我就是用的脚本,得到频率和相对强度,但是我想画有一定宽度的那种谱图。

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发表于 Post on 2019-11-18 21:25:10 | 只看该作者 Only view this author
菜鸡互啄 发表于 2019-11-18 17:59
我就是用的脚本,得到频率和相对强度,但是我想画有一定宽度的那种谱图。

展宽过程应该不是很复杂啊,假定未展宽的谱线位置在w_i处,强度为A_i,那么展宽后的谱线F(w)=∑_i Ai*M((w-wi),σ)
M是展宽函数,比如Gaussian函数的话就M((w-wi),σ)=1/a*exp(-(w-wi)^2/2σ^2)。这个过程类似于Multiwfn手册3.12.1 的部分。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-19 09:10:29 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2019-11-18 21:25
展宽过程应该不是很复杂啊,假定未展宽的谱线位置在w_i处,强度为A_i,那么展宽后的谱线F(w)=∑_i Ai*M(( ...

谢谢大佬,我试试看

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发表于 Post on 2019-11-21 16:49:44 | 只看该作者 Only view this author
菜鸡互啄 发表于 2019-11-19 09:10
谢谢大佬,我试试看

你说的是展宽问题,这是另外一个简单的问题,再找找吧

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发表于 Post on 2019-11-25 22:28:47 | 只看该作者 Only view this author
有现成的脚本

spectra.dat

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spectra.py

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发表于 Post on 2023-9-14 17:29:27 | 只看该作者 Only view this author
菜鸡互啄 发表于 2019-11-18 17:56
我用脚本得到的是一个峰位置和一个相对强度值:001 3556.5 1.000这种,但是我想画成有一定宽度的峰。是不 ...

能请问一下 如何获得峰强吗? 这个链接失效了

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