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[综合交流] 求助:是不是结构显示能量不变,温度不变就表示得到的是平衡结构?密度呢?

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求助:是不是结构显示能量不变,温度不变就表示得到的是平衡结构?密度呢?

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发表于 Post on 2020-1-7 21:27:19 | 只看该作者 Only view this author
比如做自组装模拟的过程,温度和能量都已经基本不变了,但是自组装形态还在继续变化,表明仍未达到平衡。
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发表于 Post on 2020-1-7 22:40:45 | 只看该作者 Only view this author
论坛首页google框搜“判断平衡”,有大量讨论
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-8 09:28:17 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2020-1-7 21:27
比如做自组装模拟的过程,温度和能量都已经基本不变了,但是自组装形态还在继续变化,表明仍未达到平衡。

您好  但是怎么看形态继续变化呀  是看密度没有趋于稳定的趋势么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-8 09:28:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-7 22:40
论坛首页google框搜“判断平衡”,有大量讨论

好的  谢谢S先生

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发表于 Post on 2020-1-8 16:41:49 | 只看该作者 Only view this author
dmpb 发表于 2020-1-8 09:28
您好  但是怎么看形态继续变化呀  是看密度没有趋于稳定的趋势么?

这个我只晓得计算结束后看轨迹运行来判断,在中间过程我不会看。
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发表于 Post on 2020-1-8 21:42:09 | 只看该作者 Only view this author
说清楚具体是什么体系,否则都是空谈
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-9 10:16:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-8 21:42
说清楚具体是什么体系,否则都是空谈

是水化硅酸钙 周期性体系 emmm我改变了一下控温和控压条件  密度变得就非常微小了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-9 10:16:58 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2020-1-8 16:41
这个我只晓得计算结束后看轨迹运行来判断,在中间过程我不会看。

可以啊  怎么看轨迹呀 ?我这还不够格传送图片。。

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发表于 Post on 2020-1-10 01:56:33 | 只看该作者 Only view this author
dmpb 发表于 2020-1-9 10:16
是水化硅酸钙 周期性体系 emmm我改变了一下控温和控压条件  密度变得就非常微小了

这种体系跑个几百ps一般足够达到平衡了。
轨迹通常用VMD看
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-10 10:47:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-10 01:56
这种体系跑个几百ps一般足够达到平衡了。
轨迹通常用VMD看

好的 sob老师,我还想问下 像我刚刚说的结构体系,施加应力会导致结构变形,但是到结构破坏时,也就是零界点,看什么呀?看他的晶胞长度还是密度或者其他呢?

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发表于 Post on 2020-1-11 20:42:07 | 只看该作者 Only view this author
dmpb 发表于 2020-1-10 10:47
好的 sob老师,我还想问下 像我刚刚说的结构体系,施加应力会导致结构变形,但是到结构破坏时,也就是零 ...

从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断,比如最大键长随时间变化之类的,能对应上破坏过程的显著变化即可
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-12 23:53:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-11 20:42
从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断,比如最大键长随时间变化之类的, ...

好的 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-13 00:00:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-11 20:42
从轨迹上直接就看得出来
要么自己写VMD分析脚本通过一些指标进行判断,比如最大键长随时间变化之类的, ...

VMD怎么进行提取呢?代码咱这边有么?我第一次听说VMD呢

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发表于 Post on 2020-1-13 21:03:19 | 只看该作者 Only view this author
dmpb 发表于 2020-1-13 00:00
VMD怎么进行提取呢?代码咱这边有么?我第一次听说VMD呢

公社论坛首页google框搜VMD。sobereva.com右侧选VMD也能看到我之前写的大量相关文章

做动力学的人离不开VMD
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