Gaussian显示HOMO轨道，客体轨道怎么突出显示

wzy · 发表于 Post on 2020-5-4 21:11:50

Gaussian研究主客体显示HOMO轨道时，原子数太多，客体分子的轨道看不太清，怎么处理

thanhtam · 发表于 Post on 2020-5-4 21:19:50

本帖最后由 thanhtam 于 2020-5-4 21:22 编辑

用Multiwfn，适当调整isovalue和等值面style
见 sobereva.com/269
还不满足就看http://sobereva.com/449

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2020-5-5 01:22:21

如果等值面是分立的，可以试试：http://bbs.keinsci.com/thread-16243-1-1.html
或者在基组符合要求时，或许可以把特定原子的对HOMO的贡献设为0再计算等值面
（当然在实际发表时都需要明确说明怎么处理过了）

sobereva · 发表于 Post on 2020-5-5 07:20:49

Gaussian没法显示，可视化的那叫GaussView
没有你当前的HOMO图，没法具体指导你怎么弄得更好看
反正肯定别用gview，显示速度巨慢、收费、效果差不说，设置还远不如VMD灵活。有Multiwfn程序以及Multiwfn+VMD的组合，gview看轨道的功能已经完全失去价值了。

最理想做法是按照此文的做法用VMD显示出来
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）
http://sobereva.com/449（http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html）

然后利用VMD的选择语句，可以灵活地设置显示和不显示什么区域、对不同区域单独设置显示方式、材质和着色，选择语句介绍看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

在VMD里还可以设置雾化、焦距效果。恰当利用VMD不可能得不到满意的图。

另外，利用Multiwfn还可以把不想看到的区域的轨道抹掉避免碍眼、让视觉混乱，看
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269（http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html）

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