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[CASTEP/Dmol3/MS] 请教castep如何计算虚频?我自己试了一下但是报错了,急求,谢谢

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各位老师好,这几天我做寻找过渡态的相关工作,现在准备计算寻找后的过渡态的频率。我的计算是:先激活寻找到的过渡态结构,然后在properties下选择polarization,IR and raman spectra     然后进行计算,但是计算后报错为 请问各位老师为什么会出现这样的报错呢?我不是很理解,是我的计算方法有问题吗?麻烦各位老师帮忙解答一下,谢谢谢谢

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发表于 Post on 2015-9-23 21:17:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zyj19831206 于 2015-9-23 21:20 编辑

英语都说的很清楚了,对于金属而言,计算极化是没有任何意义的,如果现在的系统是一个绝缘体,请不要选择计算方框上的“metal”按钮,就是我输入图片里的那个按钮,已经用红色箭头指出了,赝势也不能选择“ultrasoft”超软势,而只能选择"norm conserving"模守恒赝势,这个是在第二个计算方框里面选择。

QQ图片20150923211110.png (19.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 70)

计算方框

计算方框

QQ图片20150923211442.png (21.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 78)

计算方框二

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发表于 Post on 2015-9-23 22:00:06 | 只看该作者 Only view this author
频率计算可以单独计算声子(phonon)谱来判断,声子谱中设置有限差分方案(数值导数)来计算频率,当然效率也是很低的,而castep中IR或phonon计算频率如采用线性响应的方法,只能针对绝缘体和模守恒赝势,局限性也太强。

无论怎样,castep似乎应该没办法优化过渡态,也就起个判断作用。表面反应如果不涉及到+U或杂化,castep优势比dmol3小得多。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-24 12:02:50 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-23 22:00
频率计算可以单独计算声子(phonon)谱来判断,声子谱中设置有限差分方案(数值导数)来计算频率,当然效率也 ...

castep不能优化过渡态额?听到这个好伤心,谢谢老师,我再找找相关的文献,非常感谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-24 21:30:13 | 只看该作者 Only view this author
zyj19831206 发表于 2015-9-23 21:17
英语都说的很清楚了,对于金属而言,计算极化是没有任何意义的,如果现在的系统是一个绝缘体,请不要选择计 ...

非常感谢您的解答,谢谢谢谢,我是不是如果不是绝缘体就需要把metal勾选上??非常感谢,其实我不是很明白“计算极化”这个概念,我主要是想要做个频率计算看虚频,这个我应该如何解决呢?非常感谢您

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发表于 Post on 2015-9-25 15:53:42 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-23 22:00
频率计算可以单独计算声子(phonon)谱来判断,声子谱中设置有限差分方案(数值导数)来计算频率,当然效率也 ...

是不是说,含有很多金属原子的体系,没法计算频率?

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发表于 Post on 2015-9-25 16:28:29 | 只看该作者 Only view this author
qyyos 发表于 2015-9-25 15:53
是不是说,含有很多金属原子的体系,没法计算频率?

不是,恰恰相反,频率可以计算并且可以使用超软赝势,但是在castep中不能够使用线性响应的方法来计算,IR肯定没法算,因为IR默认的算法就是线性响应,也没办法修改为有限差分。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-25 17:25:49 | 只看该作者 Only view this author
qyyos 发表于 2015-9-25 15:53
是不是说,含有很多金属原子的体系,没法计算频率?

上面提示的错误是这样的,请问老师我应该如何解决?谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-25 17:27:26 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-25 16:28
不是,恰恰相反,频率可以计算并且可以使用超软赝势,但是在castep中不能够使用线性响应的方法来计算,IR ...

老师,那我应该怎样才能计算频率呢?试了好多次了,还是失败了,麻烦老师指导一下,非常感谢您

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发表于 Post on 2015-9-25 20:57:31 | 只看该作者 Only view this author
lzc 发表于 2015-9-25 17:27
老师,那我应该怎样才能计算频率呢?试了好多次了,还是失败了,麻烦老师指导一下,非常感谢您

如果你只是看频率的话直接计算Phonon就行了,计算选项的more选择有限差分。但是这样振动模也就看不到了。IR默认采用线性响应
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-25 22:05:21 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-25 20:57
如果你只是看频率的话直接计算Phonon就行了,计算选项的more选择有限差分。但是这样振动模也就看不到了。 ...

非常感谢老师,请问老师,就是将more中的method 改成finite displacement吗?还需要改其它参数吗?谢谢老师

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发表于 Post on 2015-9-25 22:43:06 | 只看该作者 Only view this author
lzc 发表于 2015-9-25 22:05
非常感谢老师,请问老师,就是将more中的method 改成finite displacement吗?还需要改其它参数吗?谢谢老 ...

一般没啥要修改的了,遇到问题再说。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-9-27 19:53:14 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-25 22:43
一般没啥要修改的了,遇到问题再说。

谢谢老师,非常感谢,在这里也祝老师中秋节快乐!健康快乐每一天~

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发表于 Post on 2015-9-28 00:28:12 | 只看该作者 Only view this author
lzc 发表于 2015-9-27 19:53
谢谢老师,非常感谢,在这里也祝老师中秋节快乐!健康快乐每一天~

不好意思,回的有点晚,最近太忙,中秋同乐。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-22 18:20:25 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-9-28 00:28
不好意思,回的有点晚,最近太忙,中秋同乐。

老师也要多注意休息

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