Gaussian计算非人为使其计算停止了，能否接着其继续向下算。

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-28 23:15:50

运用Gaussian09在SSH计算了接近3天的结构，由于学校半夜停电，计算机poweroff，而中途计算结束，请问有什么方法接着重新做吗？虽然3天在一些人眼里感觉时间不长，但是我想如果计算了一个月的结构，遇到类似这种事情，可能也不太好，所以请教各位有什么方法可以接着做。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-9-29 00:08:58

本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-9-29 00:14 编辑

结构优化
#p opt=restart，其他照抄

频率计算（IR，热力学，NMR...）
#p restart
重启计算需要上一布计算时指定了%chk = *******.chk，重启计算原样照抄
频率计算的Restart要求在之前计算的时候指定了%rwf = *****.rwf，重启计算时原样照抄

具体的去查两个关键词的Gaussian说明书

sobereva · 发表于 Post on 2015-9-29 02:47:34

怎么续算这里有全面的总结
http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 08:02:33

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 00:08
结构优化
#p opt=restart，其他照抄

谢谢详细的解答。

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 08:02:54

sobereva 发表于 2015-9-29 02:47
怎么续算这里有全面的总结
http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm

谢谢sob老师提供的链接。

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 09:05:38

sobereva 发表于 2015-9-29 02:47
怎么续算这里有全面的总结
http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm

sob老师，看了那个Gaussian的FAQ，我的想法在下面，不知道对不对：
1.优化必须有*.chk文件，频率必须有*.rwf；
2.原来计算的*.gjf文件，改为opt=restart，而且*.chk必须在原路径。比如：老师，这样写对不对（SSH里计算，*.chk文件也是原来的路径）
%a.chk=a.chk
%mem=1GB
%nprocshared=4
#p opt=restart b3lyp/6-311g(d,p) guess=read
坐标
老师我的症结是原来的文件里没有guess=read这个命令，但如果不写guess=read，直接写opt=restart计算失败，而那个链接里在重新优化的时候，也没有说用guess=read，所以我不太清楚我这么做对不对。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-9-29 11:40:57

978142355 发表于 2015-9-29 09:05
sob老师，看了那个Gaussian的FAQ，我的想法在下面，不知道对不对：
1.优化必须有*.chk文件，频率必须有* ...

Guess = read 只不过是读了分子轨道的初猜
你的体系很难SCF收敛吗？
还是你先Somehow 做了一次失败的restart，结果把chk文件破坏掉了

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 12:02:03

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 11:40
Guess = read 只不过是读了分子轨道的初猜
你的体系很难SCF收敛吗？
还是你先Somehow 做了一次失败的re ...

没有。我先用其它文件试验的，弄好了才敢那么整算了3天的体系。我那个体系很容易收敛的。我用了opt=restart，其它不变，但是出错。还是麻烦Li兄看一看，哪个地方错了？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-9-29 13:23:16

978142355 发表于 2015-9-29 12:02
没有。我先用其它文件试验的，弄好了才敢那么整算了3天的体系。我那个体系很容易收敛的。我用了opt=resta ...

你这是文件读写错误。
试试把chk改成完整路径写出来。
再就是一些奇怪的错误，比如没有磁盘的写权限，路径的名字不对之类的。

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 14:24:33

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 13:23
你这是文件读写错误。
试试把chk改成完整路径写出来。
再就是一些奇怪的错误，比如没有磁盘的写权限， ...

Li老师，我是用计算出来的out转化为gjf算，还是用原来的gjf算？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-9-29 16:04:11

978142355 发表于 2015-9-29 14:24
Li老师，我是用计算出来的out转化为gjf算，还是用原来的gjf算？

写一个新的gjf，和原来的out没关系

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 16:08:05

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 16:04
写一个新的gjf，和原来的out没关系

恩，然后和我发的图片的格式一样就行是吧？

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 21:35:02

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 16:04
写一个新的gjf，和原来的out没关系

我重新用gjf做了，还是我发的图片的那个错误。。。。。。。。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2015-9-29 22:15:47

978142355 发表于 2015-9-29 21:35
我重新用gjf做了，还是我发的图片的那个错误。。。。。。。。

可以上传gjf和chk文件吗？

978142355 · 发表于 Post on 2015-9-29 23:00:06

liyuanhe211 发表于 2015-9-29 22:15
可以上传gjf和chk文件吗？

那个没带回来，我在自己电脑做了一个丙烷的，然后中途把Gaussian09关闭了，这个可以吗？

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[Gaussian/gview] Gaussian计算非人为使其计算停止了，能否接着其继续向下算。

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