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[新手求助] 求助Gaussian溶剂模型下几何优化收敛问题

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新手想请教各位老师,使用气相中的几何优化很快就完成,改成溶剂模式(water)之后step达到30多步还没完成,也没有报错,但是不知道要收敛多久,请老师们帮忙看看input文件有没有问题啊,还有要怎么看离几何收敛还有多久啊?

SMX.gjf

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发表于 Post on 2020-7-2 19:06:08 | 只看该作者 Only view this author
三十几步很正常。

看几何优化收敛情况,可以用tsmonitor( http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =14081&fromuid=5840 )(linux下使用)

或自己在输出文件中搜索Maximum Force,看四个收敛标准。

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-2 19:18:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 XIAOZHENZHEN 于 2020-7-2 19:20 编辑
hebrewsnabla 发表于 2020-7-2 19:06
三十几步很正常。

看几何优化收敛情况,可以用tsmonitor( http://bbs.keinsci.com/forum.php ... =1408 ...

谢谢您的回复!!我用的是windows,就是感觉好久啊,看到已经出现2个YES了,过一会儿又变成4个NO,心态崩了...

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发表于 Post on 2020-7-2 21:05:10 | 只看该作者 Only view this author
毕竟电脑本地的单核比较慢,一般这样的体系在100步以内都是可以接受的,CPU时长4-5个小时很正常
只要结构能量在下降,没有保存,耐心等待就好

*最好还是用多核服务器跑,会节省很多时间,本地也可以开启多核并行计算,但win版gassian好像最多只支持到3-4核的样子,linux版可以比较好的多核计算
上海交通大学计算化学与分子生物信息学实验室
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-2 22:08:23 | 只看该作者 Only view this author
好的好的,非常感谢您!!

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发表于 Post on 2020-7-2 22:29:37 | 只看该作者 Only view this author
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
怎么监控文中也说了

计算过程注意监控收敛趋势,别没希望还继续算白浪费时间

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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喵星人

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发表于 Post on 2020-7-2 22:31:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-2 22:29
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

讲道理,一个非常正常的有机分子,纯粹只是电脑慢。。。。再就是初猜结构也不是太好

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8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-3 11:41:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-2 22:29
仔细看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

我仔细看看,谢谢sob老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-3 11:42:35 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-7-2 22:31
讲道理,一个非常正常的有机分子,纯粹只是电脑慢。。。。再就是初猜结构也不是太好

结构是从pubchem下载的...算了6个小时终于结束了!!!

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