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[新手求助] 关于键解离能BDE用的能量求助

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计算分子的BDE只需要利用单点能相减吗,还是应该也计算频率,加上ZPE呢?

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发表于 Post on 2020-9-16 18:18:39 | 只看该作者 Only view this author
要考虑ZPE。尤其当参与成键一方是氢原子时,ZPE贡献可以达到5kcal/mol量级,完全不可忽略。
此外最好再加上内能的温度校正项,以及H=U+pV的pV校正(换句话说,直接读取频率计算输出的焓校正,加到单点能上),因为BDE严格的说法是键解离焓(bond dissociation enthalpy)

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-16 20:23:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-9-16 18:18
要考虑ZPE。尤其当参与成键一方是氢原子时,ZPE贡献可以达到5kcal/mol量级,完全不可忽略。
此外最好再加 ...

十分感谢

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发表于 Post on 2020-9-17 12:38:12 | 只看该作者 Only view this author
用焓求差
怎么计算焓看
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

并且注意片段也需要优化

除非你想得到没有实际意义的0K下的BDE,否则光加个ZPE没有意义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-18 12:06:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-17 12:38
用焓求差
怎么计算焓看
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据

社长,请问,结合能和BDE的应用区别在于什么地方呢?因为看结合能的计算就很简单,只用EAB-EA-EB就计算了,而BDE要考虑焓的问题。还有一个问题就是在计算100个原子左右的有机物的单点能时,用B3LYPD3/6-311G**足够了吗,还是一定要加弥散6-311+g**呢?

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发表于 Post on 2020-9-19 09:15:28 | 只看该作者 Only view this author
li447fan 发表于 2020-9-18 12:06
社长,请问,结合能和BDE的应用区别在于什么地方呢?因为看结合能的计算就很简单,只用EAB-EA-EB就计算了 ...

BDE有确切的定义,但“结合能”没有统一的定义,必须自己在文章里写清楚是怎么定义的

显然看你算什么问题,仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html
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发表于 Post on 2024-8-3 22:45:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-19 09:15
BDE有确切的定义,但“结合能”没有统一的定义,必须自己在文章里写清楚是怎么定义的

显然看你算什么 ...

谢谢老师,感谢您的回答,我还有几个问题想请教
1.老师看到您的博文中有计算聚合物gap来一定程度反应聚合物稳定程度的,您博文中的做法是聚合物从一一直增加到16左右然后拟合曲线,看与坐标轴的交点。请问老师对于我这种聚合物,他的链间作用力比较强,请问可以用这种方法吗?或者由于我研究的聚合物是半晶聚合物且结晶度较高,请问有方法可以直接计算晶体的homo-lumo gap吗?
2.老师,想请教multiwfn针对弱相互作用,共价相互作用影响的结构稳定性问题,针对周期性的晶体结构,有没有无需挖团簇或者单链,直接进行计算比较的方法?
3.老师关于解离能垒和解离能等,不知老师有没有博文介绍?
谢谢老师,问题有点多,感谢老师的耐心解答

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发表于 Post on 2024-8-4 07:39:39 | 只看该作者 Only view this author
linlink 发表于 2024-8-3 22:45
谢谢老师,感谢您的回答,我还有几个问题想请教
1.老师看到您的博文中有计算聚合物gap来一定程度反应聚 ...

1 博文里只计算了gap,但并没有拿这个衡量稳定程度。拿gap衡量共轭聚合物的稳定程度毫无意义
晶体需要用CP2K算

2 Multiwfn本来就支持周期性体系的波函数分析,我写过大量文章,诸如
使用Multiwfn对周期性体系做键级分析和NAdO分析考察成键特征
http://sobereva.com/719http://bbs.keinsci.com/thread-47176-1-1.html
使用Multiwfn结合CP2K做周期性体系的atom-in-molecules (AIM)拓扑分析
http://sobereva.com/717http://bbs.keinsci.com/thread-46927-1-1.html
使用Multiwfn考察周期性体系的芳香性
http://sobereva.com/722http://bbs.keinsci.com/thread-47527-1-1.html

3 谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生
http://sobereva.com/506http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html
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