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[MOPAC] 使用MOPAC进行几何优化,添加MOZYME关键词,耗时反而增加了,为什么呢?

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楼主
genmer生成4个水组成的10个团簇初始构型,采用molclus调用MOPAC进行几何优化。template.mop添加MOZYME,发现耗时反而增加了,这是为什么呢?


template.mop,内容为
PM6-DH+ precise
molecule
All coordinates are Cartesian
[GEOMETRY]


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发表于 Post on 2020-11-7 13:15:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-11-7 13:17 编辑

MOZYME是给大体系用的,4个水太小了,直接用DFT优化结构都行,半经验小菜一碟(由于你的体系过小,不建议加MOZYME,因为降低了精度)。几乎所有的低标度方法,在体系小的时候,耗时总是比传统方法要多的,有个时间拐点,体系大了才有优势。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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喵星人

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发表于 Post on 2020-11-7 13:45:53 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-11-7 13:15
MOZYME是给大体系用的,4个水太小了,直接用DFT优化结构都行,半经验小菜一碟(由于你的体系过小,不建议加 ...

按照原文看精度降低倒是还好,但是小体系速度慢是真的

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发表于 Post on 2020-11-7 16:59:22 | 只看该作者 Only view this author
几百个原子再考虑MOZYME
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 21:53:33 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-11-7 13:15
MOZYME是给大体系用的,4个水太小了,直接用DFT优化结构都行,半经验小菜一碟(由于你的体系过小,不建议加 ...

原来如此。随便构建的一个体系,其实就是想比较看看。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-7 21:54:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

感谢老师解答。

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发表于 Post on 2022-1-7 10:11:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 PC-coming 于 2022-1-7 10:12 编辑
sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

老师您好,请问下MOCLUS+MOPAC做初步优化气相离子团簇(几十个原子数)的结构时,需要设置自旋多重度吗?

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发表于 Post on 2022-1-7 10:43:06 | 只看该作者 Only view this author
PC-coming 发表于 2022-1-7 10:11
老师您好,请问下MOCLUS+MOPAC做初步优化气相离子团簇(几十个原子数)的结构时,需要设置自旋多重度吗?

自旋多重度不为1的时候都得设
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发表于 Post on 2022-1-7 14:43:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-7 10:43
自旋多重度不为1的时候都得设

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2025-1-6 18:09:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-7 16:59
几百个原子再考虑MOZYME

老师我想问一下,如果优化200-300个原子的体系建议加上MOZYME吗,耗时会有明显缩短吗

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发表于 Post on 2025-1-7 01:20:03 | 只看该作者 Only view this author
绊倒铁盒 发表于 2025-1-6 18:09
老师我想问一下,如果优化200-300个原子的体系建议加上MOZYME吗,耗时会有明显缩短吗

不建议。不会
这种大小的体系还远达不到MOZYME能带来额外好处的情况
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