计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 14406|回复 Reply: 22
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 怎么计算两个极限共振式之间的能垒?

[复制链接 Copy URL]

7

帖子

0

威望

63

eV
积分
70

Level 2 能力者

各位老师好,因为在Gaussian中好像不存在绝对的极限共振式结构,呈现出来的都是电荷高度离域的状态。所以我想请教一下各位老师,有没有什么办法计算两个极限共振式结构之间的能垒?

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-11-28 10:09:34 | 只看该作者 Only view this author
“两共振式间的能垒”定义是什么

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-11-28 10:50:26 | 只看该作者 Only view this author
这是没有定义的,真实的电子结构就是在不同的共振式之间,比如以苯为例,真实的电子结构并不是一会这三个键是双键,一会那三个键是双键,而是自始至终每根键都处于单键和双键之间,而且自始至终每根键都等价。画成Kekule式只是为了方便理解,以及方便用价键理论计算,并不代表真实的电子结构,哪怕一瞬间的电子结构也不能代表。不要被某些基础课本误导了。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

1633

帖子

4

威望

4088

eV
积分
5801

Level 6 (一方通行)

喵星人

4#
发表于 Post on 2020-11-28 14:00:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-28 10:50
这是没有定义的,真实的电子结构就是在不同的共振式之间,比如以苯为例,真实的电子结构并不是一会这三个键 ...

他可能想说的是算约束性DFT的能量?

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2020-11-28 14:31:57 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-11-28 14:00
他可能想说的是算约束性DFT的能量?

CDFT能算共振式的能量,但是算不了能垒吧
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2020-11-28 18:19:42 | 只看该作者 Only view this author
我不知道你说的结构具体指什么,几何结构还是电子结构。
如果是在实际极小点D6h点群结构下,两个极限共振式之间并没有什么能垒,单一共振式的能量明显比起两个共振式混合的能量更高。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

7

帖子

0

威望

63

eV
积分
70

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-30 14:08:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-28 18:19
我不知道你说的结构具体指什么,几何结构还是电子结构。
如果是在实际极小点D6h点群结构下,两个极限共振 ...

谢谢老师的回答,是这样的,我们老师想知道这两个极限共振式之间的能量差,所以我想问一下有没有什么办法可以计算

7

帖子

0

威望

63

eV
积分
70

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-30 14:12:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-28 10:50
这是没有定义的,真实的电子结构就是在不同的共振式之间,比如以苯为例,真实的电子结构并不是一会这三个键 ...

嗯嗯,非常感谢老师的指导

7

帖子

0

威望

63

eV
积分
70

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-30 14:21:39 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2020-11-28 10:09
“两共振式间的能垒”定义是什么

老师不好意思,是我表述的不清楚,我是想问有没有什么办法可以计算这两个极限共振式结构之间的能量差?最后,谢谢老师的回复

451

帖子

9

威望

6037

eV
积分
6668

Level 6 (一方通行)

BSJ Institute

10#
发表于 Post on 2020-11-30 14:54:42 | 只看该作者 Only view this author
共振式是人为假想的结构,不存在“两个极限共振式结构之间的能量差”
想表征反应性有很多有意义得多的方法,例如考察原子电荷、轨道形状等。
如果非要得到某些极限式的能量,可以使用XMVB等价键程序。

1633

帖子

4

威望

4088

eV
积分
5801

Level 6 (一方通行)

喵星人

11#
发表于 Post on 2020-11-30 16:35:45 | 只看该作者 Only view this author
Accelerator 发表于 2020-11-30 14:54
共振式是人为假想的结构,不存在“两个极限共振式结构之间的能量差”
想表征反应性有很多有意义得多的方法 ...

直接优化完结构

然后在NWChem里面分别约束一个正电荷在N或者C上分别看看比真正的电子结构能量高多少倒是可以哦

Q-Chem和ADF也可以做这种

451

帖子

9

威望

6037

eV
积分
6668

Level 6 (一方通行)

BSJ Institute

12#
发表于 Post on 2020-11-30 17:01:17 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-11-30 16:35
直接优化完结构

然后在NWChem里面分别约束一个正电荷在N或者C上分别看看比真正的电子结构能量高多少倒 ...

这样不是纯粹的单一共振式
此外CDFT施加电荷约束能否正确表现N上带有形式电荷的共振式,我是存疑的

230

帖子

0

威望

2653

eV
积分
2883

Level 5 (御坂)

13#
发表于 Post on 2020-11-30 17:32:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 一颗赛艇 于 2020-11-30 17:33 编辑

我只能说你们老师应该是只做实验的,理论知识有缺陷,问了一个错误的问题

他们经常这样

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
zjxitcc + 2 话糙理不糙

查看全部评分 View all ratings

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

14#
发表于 Post on 2020-11-30 22:18:10 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-11-30 16:35
直接优化完结构

然后在NWChem里面分别约束一个正电荷在N或者C上分别看看比真正的电子结构能量高多少倒 ...

这样能求出能量差,但是不能求出势垒,两个共振式之间仍然是无垒反应。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

15#
发表于 Post on 2020-11-30 22:33:20 | 只看该作者 Only view this author
云归处 发表于 2020-11-30 14:21
老师不好意思,是我表述的不清楚,我是想问有没有什么办法可以计算这两个极限共振式结构之间的能量差?最 ...

我在以上几个帖子的基础上补充一下,即使算出来能量差,也不能和实验上的任何量挂钩。
如果你有办法能从实验上观察到这个中间体,你会发现真实结构自始至终处于两个结构之间的某个点,正电荷自始至终是氮上有一些,碳上有一些(其他原子上也稍微有一些,因为正电荷还可以共振到其他的位置),并不是一会在氮上,一会在碳上,你根本观察不到电子结构的变化,而且这不是因为共振太快了你实验观测不到,而是共振根本就不存在。
所谓“共振式”里的“共振”一词,完全是比喻义,不代表真的存在某种往复的电子运动。之前在凯库勒的时代,人们是相信有这种往复运动的,但是后来分子轨道理论出现以后,人们就发现这种往复运动不存在了,分子是静态地处在各个共振式的中间。不过因为共振式仍然是方便实验化学家理解的一个工具,同时在价键理论的计算中也会用到,所以这个概念仍然保存至今,且因为历史惯性原因没有改名。就像我们张口闭口说“轨道”,电子轨道是从Bohr原子模型来的,但是后来人们发现Bohr原子模型是错的,电子并不是沿着某个闭曲线绕核转的,而是弥散成电子云,不过轨道一词仍然沿用下来了。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 08:56 , Processed in 0.187294 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list