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[GROMACS] 求助:gmx energy导出的各压力分量怎么看?

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如图,gmx energy里面压力分量有9个方向的分量,分别是什么含义呢?Pres-XX是不是X方向的分量?那么Pres-XY 和Pres-YX又分别指什么呢?

JI_2$RI2GM`OTILM52EIC]K.png (25.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

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发表于 Post on 2020-12-14 16:20:59 | 只看该作者 Only view this author
这个应该是在不同方向上的压力,因为统计力学上压力是力*坐标算出来的(具体公式你自己百度吧),所以XX YY XY 应该是指不同的方向

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发表于 Post on 2020-12-14 19:04:06 | 只看该作者 Only view this author
那个是压力张量的不同分量

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)的ppt:
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-15 15:46:24 | 只看该作者 Only view this author
柠檬好酸 发表于 2020-12-14 16:20
这个应该是在不同方向上的压力,因为统计力学上压力是力*坐标算出来的(具体公式你自己百度吧),所以XX YY ...

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-15 15:46:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-14 19:04
那个是压力张量的不同分量

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2023-12-18 20:55:05 | 只看该作者 Only view this author
你好,请问vir-XY代表什么含义?

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发表于 Post on 2024-5-30 09:06:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2024-5-30 09:09 编辑
sobereva 发表于 2020-12-14 19:04
那个是压力张量的不同分量

请教一下,看了一阵ppt,但我还是没看的太懂,有三个疑问

①XYZ方向对应的是Pxx,Pyy,Pzz,那么Pxy,Pyz, Pxz又是对应什么方向呢?
②总压力对应它们的平均值,是指Pxx,Pyy,Pzz三个的平均值吗?还是Pxx,Pyy,Pzz,Pxy,Pyz, Pxz六个的平均值?
③总压力为什么是平均值,而不是他们的总和?
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发表于 Post on 2024-5-31 09:39:25 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2024-5-30 09:06
请教一下,看了一阵ppt,但我还是没看的太懂,有三个疑问

①XYZ方向对应的是Pxx,Pyy,Pzz,那么Pxy, ...

1 没法简单地理解,只能理解为相应两个方向间的耦合项
2 前者
3 就是那么定义的
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