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[VMD] 求助:用vmd显示分子表面静电势能图的时候总是显示很多黑色的区域

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Level 4 (黑子)

我vmd显示颜色的方式是红白蓝,不知道那个黑色是怎么回事。我色彩刻度范围是按照multiwfn算出的最大值最小值来取的。我也尝试调节其他范围数值,排除是超出范围的影响,也不奏效。用卢老师那个渲染脚本渲染完也还是有这些黑色区域。琢磨了很久仍不知道如何解决,麻烦各位老师指点,谢谢!

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发表于 Post on 2021-4-1 14:47:10 | 只看该作者 Only view this author
说明用的Multiwfn的具体更新日期,是用Multiwfn内部代码还是调用的cubegen,输入文件是什么格式怎么产生的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-4-1 16:09:55 | 只看该作者 Only view this author
猜测可能是你的结构在 VMD 太大了以至于超出了显示界面。
在键盘上按 + 号,让结构归位到显示窗口中心试试?
注意:+ 号是按 Shift 和 = 得到的。

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发表于 Post on 2021-11-8 01:12:51 | 只看该作者 Only view this author
我今天也出现了类似的情况,检查了cub文件没什么异常,重新载入了一次没有黑色区域了,个人感觉原因可能和电脑或者vmd相关,而不是Multiwfn。

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