CP2K计算QMMM时提示QM区错误

马博士 · 发表于 Post on 2021-6-24 08:56:32

在用CP2K计算QMMM时，提交正常计算，但是在计算一段时间后，就提示QM/MM QM atoms must be fully contained in the same image of the QM box - No wrapping of coordinates is allowed! QM区Cell设置大小和MM区一样大，也增加了QM区和MM区原子之间的LJ势，但是依旧出现这个错误。附件是提交文件以及报错信息。请大家帮忙看看是什么原因造成的

chenjinfeng850 · 发表于 Post on 2021-6-25 16:43:26

感觉像是Z 方向上水太少了造成的，把Z方向上水层加厚
或者你把PBC去掉试一试

马博士 · 发表于 Post on 2021-6-26 08:44:55

chenjinfeng850 发表于 2021-6-25 16:43
感觉像是Z 方向上水太少了造成的，把Z方向上水层加厚
或者你把PBC去掉试一试

好的，我试一下，非常感谢

函数与激情 · 发表于 Post on 2021-7-31 08:42:23

Hello, the error in not the the molecule has left the box but that the molecule has separated into parts separated by more than a box (i.e. exploded). This probabably means some bad parameters in your setup.

Matt
引自 https://groups.google.com/g/cp2k/c/F86XGaqSCeE

elpa · 发表于 Post on 2021-8-14 22:05:57

应该是WALLS的问题，那个QUADRATIC墙到底是什么意思？作用方式是什么？
墙换成REFLECTIVE就不报这个错误了。

elpa · 发表于 Post on 2021-8-30 17:19:54

elpa 发表于 2021-8-14 22:05
应该是WALLS的问题，那个QUADRATIC墙到底是什么意思？作用方式是什么？
墙换成REFLECTIVE就不报这个错误了 ...

不是墙的问题，换了墙有时候还会遇到。可能就是谷歌group里说的，分子被分到了两个盒子

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[CP2K] CP2K计算QMMM时提示QM区错误

浏览过的版块