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[波函数分析求助] 关于键临界点BCP计算氢键键能

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老师,您好,根据文章计算分子内氢键键能的几种方法http://sobereva.com/522http://bbs.keinsci.com/thread-15496-1-1.html),这种方法仅限气相中计算氢键键能吗?可不可用在溶剂中分子计算?不能的话,如果计算溶剂中分子间氢键应该怎么计算呢?比如一个分子在甲醇溶剂中与一个甲醇分子之间形成氢键,我该怎么算它俩之间氢键的结合能呢?谢谢老师了

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发表于 Post on 2021-9-20 23:03:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-9-20 16:05 编辑

除了BCP以外的那些方法都可以在溶剂里用。BCP法我觉得应该不能算溶剂里的绝对氢键强度(除非有文献专门对溶剂里的氢键强度重新拟合了线性关系,你可以查一下有没有),但是比较同类氢键的相对强度还是可靠的。此外注意,用隐式溶剂模型时,只有结合自由能的结果比较靠谱,结合能/结合焓算不准,因为溶剂化自由能一般没办法拆成焓和熵的贡献
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2021-9-21 06:02:40 | 只看该作者 Only view this author
BCP拟合的那个式子没法直接用于算溶剂中的。溶剂下的氢键键能还得考虑溶解自由能。
算溶液下的直接整体电子能量减去俩片段电子能量就完了,电子能量在隐式溶剂模型下计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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发表于 Post on 2023-3-10 08:42:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-9-21 06:02
BCP拟合的那个式子没法直接用于算溶剂中的。溶剂下的氢键键能还得考虑溶解自由能。
算溶液下的直接整体电 ...

那我想请教一下,如果想算溶剂中的分子内氢键,该选哪种方式进行计算呢?主要想比较手性对映异构体间的分子内氢键差异,只需要一个相对比较的结果即可。谢谢老师

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发表于 Post on 2023-3-11 23:18:12 | 只看该作者 Only view this author
Sunyuting 发表于 2023-3-10 08:42
那我想请教一下,如果想算溶剂中的分子内氢键,该选哪种方式进行计算呢?主要想比较手性对映异构体间的分 ...

严格计算参考下文
计算分子内氢键键能的几种方法
http://sobereva.com/522http://bbs.keinsci.com/thread-15496-1-1.html

对于只是大致对比相对大小,照常按下文基于BCP性质算就可以
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html
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发表于 Post on 2023-3-13 13:41:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-11 23:18
严格计算参考下文
计算分子内氢键键能的几种方法
http://sobereva.com/522(http://bbs.keinsci.com/th ...

受教了,谢谢老师

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