求助如何合并AMBER输出OUT文件？

hhhnano · 发表于 Post on 2021-11-17 22:25:33

我在进行AMBER计算时，突然断电，就将第一次的RST文件作为输入第二次续跑，这样就有两个输出文件，1.out和2.out, 如何合并这两个out文件？非常感谢！

rpestana94 · 发表于 Post on 2021-11-17 23:13:05

本帖最后由 rpestana94 于 2021-11-17 10:16 编辑

Why do you need to combine these two files? You can just copy and paste the info when it begins to show the cycles, energy, and all that info which is the important info, maybe with a script, I don't think there is an automatic tool for this task.
Look at this tutorial, maybe it can help https://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial1/section6.htm

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-18 06:02:08

cat 1.out 2.out > new.out
如果非要无缝衔接，自己再编辑new.out

hhhnano · 发表于 Post on 2021-11-18 09:59:54

非常感谢rpestana94和sob老师，已经合并文件。

WJun · 发表于 Post on 2022-10-27 21:23:40

本帖最后由 WJun 于 2022-10-27 21:24 编辑

请问合并后两个out文件中前后顺序不一致怎么处理呀

一个用户名 · 发表于 Post on 2022-10-28 19:54:27

本帖最后由一个用户名于 2022-10-28 19:55 编辑

WJun 发表于 2022-10-27 21:23
请问合并后两个out文件中前后顺序不一致怎么处理呀

我不太明白这么做的目的，因为TIME已经是连续的了，再去纠结NSTEP连不连续没有意义。实在想改，可以自行编程进行文件处理。没有开发者会对这么特殊的需求提供解决方案的。

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