求助：CP2K产生的PDB格式轨迹文件如何转换为XYZ格式的轨迹文件

龙渊含光 · 发表于 Post on 2021-11-23 21:39:02

求助：CP2K产生的PDB格式轨迹文件如何转换为XYZ格式的轨迹文件？

丁越 · 发表于 Post on 2021-11-23 21:50:29

不用费啥劲弄个转化脚本啊，你用Multiwfn生成的MD的inp文件默认就是xyz格式。
或者你可以用VMD打开轨迹文件，然后file里面选择保存成xyz格式。

龙渊含光 · 发表于 Post on 2021-11-23 21:58:04

丁越发表于 2021-11-23 21:50
不用费啥劲弄个转化脚本啊，你用Multiwfn生成的MD的inp文件默认就是xyz格式。
或者你可以用VMD打开轨迹文 ...

明白了，谢谢！

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2022-2-22 10:56:53

丁越发表于 2021-11-23 21:50
不用费啥劲弄个转化脚本啊，你用Multiwfn生成的MD的inp文件默认就是xyz格式。
或者你可以用VMD打开轨迹文 ...

请问丁老师，&符号后面的彩色输入文件信息是怎么设置的？

丁越 · 发表于 Post on 2022-2-22 18:31:40

不会扣篮的后卫发表于 2022-2-22 10:56
请问丁老师，&符号后面的彩色输入文件信息是怎么设置的？

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2022-2-22 23:11:43

丁越发表于 2022-2-22 18:31
用这个vim插件https://www.cp2k.org/tools:vim

好的，谢谢丁老师！

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