请教计算固相中的重整能和黄昆因子

fcb0310 · 发表于 Post on 2021-12-22 19:11:02

各位老师好，最近在学习用dushin程序包计算分子的重整能和黄昆因子，是关于S0和S1态的，目前固相中的S0和S1的构型已经采用ONIOM模型QMMM方法优化得到了（中心分子为high层，周围分子为low层：不做优化）。
我也测试过气相中分子的黄昆因子：通过高斯算一个频率，，然后在用dushin读取相关的log和fchk文件，结果正常。
我的问题是算晶体分子的黄昆因子时，是把QM部分（high层）的分子单独取出算频率，还是分子团簇中所有的分子都算。
（我测试过把分子团簇中的分子都算频率，再用dushin程序包计算，结果失败了）

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-23 13:56:54

算重组能本身没任何理由用dushin，只有做重组能分解的时候才需要用
严格来说没法算固相中某个分子的振动，本来实际晶体的振动中分子间都是耦合的。撑死了也就是用簇模型，把周围的分子都冻结然后做opt freq，此时只有中央一个分子振动。

HONEYJ · 发表于 Post on 2022-5-18 09:53:33

sobereva 发表于 2021-12-23 13:56
算重组能本身没任何理由用dushin，只有做重组能分解的时候才需要用
严格来说没法算固相中某个分子的振动， ...

sob老师，您好，我像你所说用簇模型得到中心分子的频率，我在用dushin做重组能分解时,会出现原子数过多的报错，无法用dushin分解，尝试用http://bbs.keinsci.com/thread-28708-1-1.html帖子说的用FCHT方法做的时候也会出现IndexError: list index out of range的错误。所以有个问题想请教你，怎么做可以提取中心分子的振动信息做重组能分解，还请老师赐教。

SunYiiiiiT · 发表于 Post on 2023-10-17 19:53:26

哥们你的这个问题解决了吗

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[新手求助] 请教计算固相中的重整能和黄昆因子