自由基化学计算课题

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-21 17:25:18

各位老师好，我是一名硕一新生，目前所在课题组为有机自由基实验组，组里做单自由基、双自由基（如spin-spin相互作用、闭壳醌式⇌开壳双自由基），本科在理论与计算组呆过一段时间，目前主要在组里做一些简单的应用性计算（能垒、芳香性、自旋密度等），但组里没有老师能够指导我，也报名参加了kein量化初级班，对计算有了系统的初步认识，自己也对计算很感兴趣，经常看sob老师的博文并练习，由于课题组毕业要求需要一篇文章，还请老师们可以指点一下有关自由基的相关计算小课题。谢谢！

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-1-21 17:33:10

这是你老板要做的事。。。大家给你推荐课题，然后你做了，万一你老板不喜欢，那也白做。

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-21 17:55:41

zjxitcc 发表于 2022-1-21 17:33
这是你老板要做的事。。。大家给你推荐课题，然后你做了，万一你老板不喜欢，那也白做。

老板还是支持我的，他自己也不懂他说只要我能搞出来就可以投

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2022-1-21 18:32:42

你们组在做什么实验，你就做对应的计算呗。至少可以从这个思路出发。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-21 18:38:28

我觉得是不是贴一下你们组的主页比较好，这样大家可以推荐一些和你们组研究方向更加贴近的课题

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2022-1-21 20:04:31

设计课题要读大量相关的文献才能知道什么东西做过了、什么东西有意义，你跑到这里来问，得到的通常都是拍脑袋就能瞬间想出来的想法，这些想法要么不值得做、要么是馊主意、要么已经被做过了，成功率极低。

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-21 20:11:58

对于随便找个小课题的目的，可以google学术搜集几十篇自由基体系的计算文章，把别人研究过的体系上面的元素、基团变一变，考察元素、基团的不同对应自由基特征的不同（几何和电子结构、势垒、反应能等等）。

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-22 16:40:57

本帖最后由 QuantumicGuy 于 2022-1-22 17:15 编辑

wzkchem5 发表于 2022-1-21 18:38
我觉得是不是贴一下你们组的主页比较好，这样大家可以推荐一些和你们组研究方向更加贴近的课题

老师好，我们组大致做的是这些分子的衍生

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-22 16:41:24

谢谢各位老师的指点！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-22 16:46:47

QuantumicGuy 发表于 2022-1-22 09:40
老师好，我们组大致做的是这些分子的衍生

画得有问题吧，左边两个都不可能是自由基阳离子啊，电子数不对

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-22 17:10:14

本帖最后由 QuantumicGuy 于 2022-1-22 17:15 编辑

wzkchem5 发表于 2022-1-22 16:46
画得有问题吧，左边两个都不可能是自由基阳离子啊，电子数不对

已修改

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-22 19:47:06

QuantumicGuy 发表于 2022-1-22 09:40
老师好，我们组大致做的是这些分子的衍生

我觉得一个可以考虑的方向是，训练一个神经网络模型，给定一个分子结构（比如SMILES或者三维坐标），判断它是不是双自由基，如果是的话是单重态双自由基还是三重态双自由基。训练的数据集用量化计算产生。（当然，建议先查一下有没有人做过）
一旦有了这样的方法，你就可以大规模虚拟筛选可能是双自由基的分子，筛出来比较可能是的结构再去合成，这样大幅度提高你们做实验的成功率。

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-1-22 20:09:53

wzkchem5 发表于 2022-1-22 19:47
我觉得一个可以考虑的方向是，训练一个神经网络模型，给定一个分子结构（比如SMILES或者三维坐标），判断 ...

谢谢老师！我看看文献学习一下

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[综合交流] 自由基化学计算课题