计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3029|回复 Reply: 13
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 为什么反应能垒最低的路径不是反应速率常数最大的路径

[复制链接 Copy URL]

111

帖子

0

威望

367

eV
积分
478

Level 3 能力者

请问在所有反应路径中用高斯算的吉布斯自由能垒最低的路径和基于过渡态理论(考虑隧穿效应,在298K下)用kisthelp算的反应速率常数最大的路径不是一条,是为什么呢?

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2022-5-4 19:41:54 | 只看该作者 Only view this author
因为对于你的体系,自由能垒比较高的路径的隧穿效应恰好比较强,隧穿效应的差别对速率常数的影响恰好比自由能垒的差别的影响大
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2022-5-5 08:31:29 | 只看该作者 Only view this author
对比一下考虑和不考虑隧道效应的情况自然就知道了
搞清楚都有什么因素影响k,自由能垒和k是什么关系,下文里有公式
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

111

帖子

0

威望

367

eV
积分
478

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-5 20:11:09 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-4 19:41
因为对于你的体系,自由能垒比较高的路径的隧穿效应恰好比较强,隧穿效应的差别对速率常数的影响恰好比自由 ...

隧道效应因子是能垒大的大

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2022-5-5 20:59:00 | 只看该作者 Only view this author
hyr95 发表于 2022-5-5 13:11
隧道效应因子是能垒大的大

对于你的体系是这样的,但是这不是普遍规律,其他体系很可能能垒大的反应隧穿效应小
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

111

帖子

0

威望

367

eV
积分
478

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-5 21:45:56 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-5 20:59
对于你的体系是这样的,但是这不是普遍规律,其他体系很可能能垒大的反应隧穿效应小

但是是什么因素导致的呢,温度也相同

111

帖子

0

威望

367

eV
积分
478

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-5 21:48:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-5 08:31
对比一下考虑和不考虑隧道效应的情况自然就知道了
搞清楚都有什么因素影响k,自由能垒和k是什么关系,下文 ...

感谢老师,我还是很想弄清楚为什么软件通过TST不考虑隧道校正因子算的速率常数结果和自由能垒相差那么大

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2022-5-5 23:25:44 | 只看该作者 Only view this author
hyr95 发表于 2022-5-5 14:48
感谢老师,我还是很想弄清楚为什么软件通过TST不考虑隧道校正因子算的速率常数结果和自由能垒相差那么大

你是说,即便不考虑隧穿效应,也和自由能垒的结论是相反的?
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2022-5-5 23:29:24 | 只看该作者 Only view this author
hyr95 发表于 2022-5-5 14:45
但是是什么因素导致的呢,温度也相同

影响隧穿校正的不仅是温度,还包括虚频的大小,一般而言虚频的绝对值越大隧穿校正因子越大(但这个规律只有在虚频足够小时才严格成立,否则只是大部分时候成立,并不必然成立)。可以去查一下Wigner校正的公式就知道了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

111

帖子

0

威望

367

eV
积分
478

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-15 18:09:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-5 23:29
影响隧穿校正的不仅是温度,还包括虚频的大小,一般而言虚频的绝对值越大隧穿校正因子越大(但这个规律只 ...

非常感谢

76

帖子

0

威望

357

eV
积分
433

Level 3 能力者

11#
发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-5 23:29
影响隧穿校正的不仅是温度,还包括虚频的大小,一般而言虚频的绝对值越大隧穿校正因子越大(但这个规律只 ...

老师请问对于没有过渡态的反应(例如单电子转移),如何计算隧穿效应呢?

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2024-11-24 14:41
老师请问对于没有过渡态的反应(例如单电子转移),如何计算隧穿效应呢?

用instanton方法,参见https://doi.org/10.1021/acs.jpcl ... VoR&rel=cite-as
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

76

帖子

0

威望

357

eV
积分
433

Level 3 能力者

13#
发表于 Post on 前天 13:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-11-24 22:55
用instanton方法,参见https://doi.org/10.1021/acs.jpclett.4c01098?urlappend=%3Fref%3DPDF&jav=VoR&re ...

老师,请问这个理论是否还没有现成的软件可以实现。因为我不是搞理论的,学软件还可以,从原理出发计算还是不太行……

1万

帖子

0

威望

7406

eV
积分
18180

Level 6 (一方通行)

14#
发表于 Post on 前天 13:16 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2024-11-25 06:01
老师,请问这个理论是否还没有现成的软件可以实现。因为我不是搞理论的,学软件还可以,从原理出发计算还 ...

这篇文章的作者Jeremy Richardson有软件,没有公开发布,但是给他发邮件他会给
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 17:52 , Processed in 0.172544 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list