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[综合交流] 阳离子存在下A和B吸附能的计算公式纠结

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本帖最后由 ReviewReview 于 2022-6-6 10:37 编辑

Lu老师和各位小伙伴们:
您们好!
我的纠结/烦恼如下:
对于无离子的水溶液我知道可以通过如下公式来计算A和B之间的Adsorption energy:
Ea=E(total)-E(A)-E(B)
但是对于含有阳离子的水溶液我不知道怎么来算A和B之间的Adsorption energy。心里有如下三条路线:
1)先得到阳离子和A的吸附稳定构型并计算单点能,然后再用得到的阳离子-A稳定构型去和B互作进一步得到阳离子-A-B的吸附稳定构型并计算单点能,最后用如下公式来计算吸附能:
Ea=E(total)-E(阳离子-A)-E(B)
2)先得到阳离子和B的吸附稳定构型并计算单点能,然后再用得到的阳离子-B稳定构型去和A互作进一步得到阳离子-B-A的吸附稳定构型并计算单点能,最后用如下公式来计算吸附能:
Ea=E(total)-E(阳离子-B)-E(A)
3)直接将阳离子、A、B放在一起,然后进行结构优化并计算单点能,最后用如下公式来计算吸附能:
Ea=E(total)-E(阳离子)-E(A)-E(B)【我对这个公式总有点疑神疑鬼,总觉的哪里不对劲儿,特别想听听您的评价】
综上所述,我现在来到了一个十字路口,我该选择那一条路线呢?

参考文献:
1. DOI: 10.1021/acs.jpcc.7b06454
2. DOI: 10.1021/acsomega.9b01570
3. DOI: 10.1016/j.cplett.2021.138672

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发表于 Post on 2022-6-1 15:27:19 | 只看该作者 Only view this author
先计算阳离子和A的吸附、阳离子和B的吸附、阳离子和total的吸附,看哪个热力学上有利(注意必须看吸附自由能而非吸附能,需要做浓度校正,并且除非实验已知吸附位点否则必须做构型搜索)。如果有利,算相应物种的时候就带着阳离子算;否则就不带着阳离子算。
另外如果溶液里有阳离子,必然意味着还有阴离子。如果有除了A、B、total以外的阴离子,那么阴离子也必须考虑。

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-2 17:27:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-1 15:27
先计算阳离子和A的吸附、阳离子和B的吸附、阳离子和total的吸附,看哪个热力学上有利(注意必须看吸附自由 ...

首先学生万分感谢您的宝贵建议!
听了您的讲解,深深觉得您的这个思路逻辑层层递进,严谨无缝。
接下来,我要为我的含糊表述给您带来的理解上的小小偏差向您致歉,其实在我的问题中的total指的是阳离子-A-B三者耦合体系在结构优化后的单点能,即总能量。感觉您把我的total理解成了另一种参与吸附的物质了,所幸这对于我们问题的顺畅交流影响并不大,这是我的表述不当所致,以后注意严谨表述。
最后,我准备在您给我的建议的基础上继续和您交流几个问题,内容如下:
1)您的这条建议“先计算阳离子和A的吸附、阳离子和B的吸附、阳离子和total的吸附,看哪个热力学上有利(注意必须看吸附自由能而非吸附能,并且除非实验已知吸附位点否则必须做构型搜索)。”我已理解并记下;
2)您的这条建议“需要做浓度校正”,我开始不懂,在自己找了这个视频“https://www.bilibili.com/video/B ... C0685&ts=1654078726”学习了之后,我的理解是我自己的体系主要是物理吸附,并没有发生化学反应和价态变化,所以我猜我的体系的计算是不是不需要进行浓度校正啊?
3)在讨论这个问题前,我觉得我需要表明自己的研究领域,我是环境工程专业水处理领域的,我们领域研究水污染的顶级期刊Water Research里的文章在考虑水质条件时一般考虑的是pH, 单价阳离子Na+, 二价阳离子Ca2+/Mg2+, 没咋见过考虑阴离子的比如氯离子Cl-。此外我问题中的那三篇采矿领域的参考文献也是只考虑了Na+/Ca2+/Mg2+这三种阳离子,没有涉及阴离子。所以我在想我自己的这个研究“阳离子存在下对A和B吸附影响”的实验计算相结合的博士课题,在用DFT计算来从分子层面解释实验现象时能否也不把阴离子比如氯离子Cl-放进去啊?不然的话计算起来有些复杂了。
再次感谢!渴望您的答复!
轻舟一过万重山。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 21:46:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-1 15:27
先计算阳离子和A的吸附、阳离子和B的吸附、阳离子和total的吸附,看哪个热力学上有利(注意必须看吸附自由 ...

还有老师,吸附自由能的公式是怎么算的了,和吸附能有啥区别?我知道吸附能的公式是Ea=E(total)-E(A)-E(B)。
轻舟一过万重山。

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发表于 Post on 2022-6-13 21:57:53 | 只看该作者 Only view this author
ReviewReview 发表于 2022-6-13 14:46
还有老师,吸附自由能的公式是怎么算的了,和吸附能有啥区别?我知道吸附能的公式是Ea=E(total)-E(A)-E(B ...

一样的,把吸附能里面所有能量替换为对应的自由能。
不要死记硬背吸附能、吸附自由能之类的怎么算,你就记得吸附能是吸附反应的反应能,吸附自由能是吸附反应的反应自由能,然后再按“反应能等于产物能量之和减去反应物能量之和、反应自由能等于产物自由能之和减去反应物自由能之和”,就可以自然地推出吸附能和吸附自由能的表达式。要不然的话以后遇到一个稍微不一样的过程(比如吸附质A从表面上置换掉另一吸附质B的能量变化)你又不会算了。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 22:52:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-13 21:57
一样的,把吸附能里面所有能量替换为对应的自由能。
不要死记硬背吸附能、吸附自由能之类的怎么算,你就 ...

嗯嗯,记住啦,谢谢老师!
轻舟一过万重山。

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