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[Multiwfn使用咨询] 请问使用Multiwfn计算分子体积可以用.mol2当做输入文件吗?

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如题,请问在sob老师的这篇博文http://sobereva.com/102中提到的使用Multiwfn基于MT方法计算分子体积,输入文件可以是.mol2文件吗?(我分别使用几何优化和频率分析的.fch文件和.mol2文件当做输入文件都计算出了分子体积,但这两个值差距有点大)

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发表于 Post on 2022-6-28 15:35:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snljty2 于 2022-6-28 15:58 编辑

认真读第2段和第3段,写的不能更清楚了...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-28 15:43:21 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-28 15:35
认真读第2段,写的不能更清楚了...

好的.........是我一目十行了,另外请问我用sob老师帖子里的蒙特卡罗方法和MT方法算的分子体积差距很大这是怎么回事?

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发表于 Post on 2022-6-28 16:00:21 | 只看该作者 Only view this author
UTM 发表于 2022-6-28 15:43
好的.........是我一目十行了,另外请问我用sob老师帖子里的蒙特卡罗方法和MT方法算的分子体积差距很大这 ...

没细节没法说
MT方法的精度依赖于格点间距,MC方法的精度依赖于撒点数。而且MC方法既可以基于原子范德华球构造的范德华表面计算,也可以基于电子密度等值面定义的范德华表面计算。文章都写得超级清楚。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-28 16:40:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-28 16:00
没细节没法说
MT方法的精度依赖于格点间距,MC方法的精度依赖于撒点数。而且MC方法既可以基于原子范德华 ...

MT方法的话使用的输入文件是.fch文件,计算级别是b3lyp-d3/6-311g(d,p),默认格点间距,结果是527.80立方埃;MC方法1(基于原子范德华球构造的范德华表面)输入文件是.mol2,i=10结果是378.77,i=20结果是373.00;MC方法2(基于电子密度等值面定义的范德华表面)输入文件和MT方法一样,i,x,k=10,0.001,1.7结果是544.74,MC方法2和MT方法算出来的值相差不大,为什么MC方法1差了那么多?

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发表于 Post on 2022-6-29 01:24:38 | 只看该作者 Only view this author
UTM 发表于 2022-6-28 16:40
MT方法的话使用的输入文件是.fch文件,计算级别是b3lyp-d3/6-311g(d,p),默认格点间距,结果是527.80立方 ...

本来两种方法定义的范德华表面就相差甚大,差别当然不可能不大

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-29 10:42:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-29 01:24
本来两种方法定义的范德华表面就相差甚大,差别当然不可能不大

好的

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