在VMD中如何求径向分布函数？

护卫天使 · 发表于 Post on 2022-7-8 18:52:02

老师们好，我想在VMD中计算稀土La周围的氧原子的分布情况，从而判断配位数。遇到了以下问题：1，unit cell 的大小该如何设置才合适？ 2，输入文件是否可以是记录了2000帧结构的.xyz文件？3，写的选择语句是否可行？

丁越 · 发表于 Post on 2022-7-8 21:34:33

1. 按照你的输入文件里晶胞大小设置，不会语法的话将该晶体结构载入Multiwfn，初始界面就有VMD设置晶胞周期性的语法
2. 可以
3. 分别填element La element O

护卫天使 · 发表于 Post on 2022-7-8 23:40:16

丁越发表于 2022-7-8 21:34
1. 按照你的输入文件里晶胞大小设置，不会语法的话将该晶体结构载入Multiwfn，初始界面就有VMD设置晶胞周期 ...

好的，感谢！

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