GROMACS运行MD的时候检测不到gpu（已解决）

bdx · 发表于 Post on 2022-7-27 13:36:05

本帖最后由 bdx 于 2022-8-5 14:52 编辑

编译的时候选择的是支持gpu的

nivida-smi显示如下

然后我使用gmx mdrun -v -deffnm md -nb gpu，显示检测不到gpu

请问一下各位老师是哪里出了问题，是不是有什么和gpu相关的东西我要手动启动一下？比较电脑盲

牧生 · 发表于 Post on 2022-7-27 13:47:40

本帖最后由牧生于 2022-7-27 13:52 编辑

试试指定gpu的编号呢 gmx mdrun -v -deffnm md -gpu_id 0
如果单台机子，不要编译mpi版本 http://sobereva.com/458

bdx · 发表于 Post on 2022-7-27 14:11:19

牧生发表于 2022-7-27 13:47
试试指定gpu的编号呢 gmx mdrun -v -deffnm md -gpu_id 0
如果单台机子，不要编译mpi版本 http:// ...

指定编号没用
可是我要做副本交换动力学，必须要MPI啊，不加-nb gpu的时候MPI还是可以正常用的，加上去以后MPI也用不了

lyj714 · 发表于 Post on 2022-7-27 14:44:52

CUDA runtime那一行是N/A明显是有问题的，建议重装cuda

bdx · 发表于 Post on 2022-8-4 14:02:57

lyj714 发表于 2022-7-27 14:44
CUDA runtime那一行是N/A明显是有问题的，建议重装cuda

已解决，感谢
虽然不知道之前是哪里出了问题，不过用官网的runfile（local）方法重装了cuda并重新配置了环境变量之后确实解决了

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