请教完成计算后误删log文件的恢复方法（chk和rwf文件均完整保留）

limaolin0 · 发表于 Post on 2022-8-21 23:28:24

本帖最后由 limaolin0 于 2022-8-22 02:39 编辑

大家好，我刚刚在集群上用gaussian16完成了一个300个原子左右簇模型的DFT计算。由于学校集群每隔24小时杀一次任务，所以我保留了chk和rwf文件信息。同时定时运行高斯的restart关键词，以便计算能不停地运行下去。经过大约一周左右完成了计算，但是log文件被反复重新写入，给出的信息极少极少。由于计算的是过渡态，计算周期实在太长，不想重新计算。现在有计算完成后完整的chk和rwf文件，请问一下是否什么方法可以重新恢复log文件？不胜感激。

冰释之川 · 发表于 Post on 2022-8-22 08:45:28

本帖最后由冰释之川于 2022-8-22 08:46 编辑

没法不通过计算直接从chk和restart相关文件恢复log输出，
只能基于优化好的结构重新算个单点产生log文件。（P.s.你们学校集群挺有意思的，还每24小时杀一次任务……）

sobereva · 发表于 Post on 2022-8-22 09:44:59

直接找学校集群投诉
哪有这么变态的规矩。死活不改的话干脆自己买机子完了

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-8-22 09:49:59

每隔24小时杀一次任务，这种我在测试队列见过

我当时看到的测试队列不收费，供用户测试用的

limaolin0 · 发表于 Post on 2022-8-22 21:11:18

冰释之川发表于 2022-8-22 08:45
没法不通过计算直接从chk和restart相关文件恢复log输出，
只能基于优化好的结构重新算个单点产生log文件。 ...

谢谢，已重新计算，学校这个cluster应该是在测试中，奈何性能非常不错，又是免费的。

limaolin0 · 发表于 Post on 2022-8-22 21:24:04

sobereva 发表于 2022-8-22 09:44
直接找学校集群投诉
哪有这么变态的规矩。死活不改的话干脆自己买机子完了

社长，还不只这样，学校用双路AMD EPYC 7763搭配较新的red hat 8.6的系统，使用最新版的Gaussian16 C.02 ，一旦计算Hessian矩阵时，会大概率莫名其妙的结束任务（无报错无输出信息）。

limaolin0 · 发表于 Post on 2022-8-22 21:28:39

zjxitcc 发表于 2022-8-22 09:49
每隔24小时杀一次任务，这种我在测试队列见过我当时看到的测试队列不收费，供用户测试用的

测不测试不知道，但是是真免费，可以实现CPU自由

sobereva · 发表于 Post on 2022-8-23 10:39:42

建议三万块钱整个双路8375C机子，学校的cluster不好跑的放自己机子上跑，能白嫖学校的cluster就白嫖

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[Gaussian/gview] 请教完成计算后误删log文件的恢复方法（chk和rwf文件均完整保留）

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