计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2604|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] 求助,在使用molclus调用gaussian进行优化时出现报错

[复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

53

eV
积分
58

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
Thread and Process ID are zero in wsystem: No such file or directory
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file
请问该问题怎样解决?

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

2#
发表于 Post on 2022-8-22 14:35:58 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2022-8-22 14:40 编辑

八成是Molclus调用的gjf文件出了问题,包含但不限于,关键词错了,有中文符号,空行不对。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

5

帖子

0

威望

53

eV
积分
58

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-22 15:09:07 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-22 14:35
八成是Molclus调用的gjf文件出了问题,包含但不限于,关键词错了,有中文符号,空行不对。

您好,我检查了调用的gjf文件,它是gaussian自己生成的文件,里面的关键词应该是正确的,还可能是哪里的问题呢

1万

帖子

0

威望

9885

eV
积分
22129

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2022-8-22 15:11:27 | 只看该作者 Only view this author
元宇宙 发表于 2022-8-22 08:09
您好,我检查了调用的gjf文件,它是gaussian自己生成的文件,里面的关键词应该是正确的,还可能是哪里的 ...

检查gjf文件里有没有opt关键词,如果没有,加上,如果有,上传完整的高斯输入输出文件(注意不是molclus输入输出文件),我们看一下
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

5#
发表于 Post on 2022-8-22 15:34:33 | 只看该作者 Only view this author
元宇宙 发表于 2022-8-22 15:09
您好,我检查了调用的gjf文件,它是gaussian自己生成的文件,里面的关键词应该是正确的,还可能是哪里的 ...

Gaussian自己生成的文件还有改成Molclus能读取的template。有些隐秘错误很难看出来,比如有个中文空格,Molclus也会报错。所以最省事方法,直接上传gjf。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

5

帖子

0

威望

53

eV
积分
58

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-22 15:47:17 | 只看该作者 Only view this author
您好,molclus生成的gjf文件我发下,高斯的输入输出文件没有找到来 @wzkchem5

gau.gjf

1.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 39

gau.out

4.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 18

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

7#
发表于 Post on 2022-8-22 16:03:26 | 只看该作者 Only view this author
元宇宙 发表于 2022-8-22 15:47
您好,molclus生成的gjf文件我发下,高斯的输入输出文件没有找到来 @wzkchem5

你用了Gaussian 09 C,不支持DFT-D3,建议升级到Gaussian 09 D以上
http://sobereva.com/210
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

1万

帖子

0

威望

9885

eV
积分
22129

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2022-8-22 16:06:44 | 只看该作者 Only view this author
元宇宙 发表于 2022-8-22 08:47
您好,molclus生成的gjf文件我发下,高斯的输入输出文件没有找到来 @wzkchem5

你上传的就是高斯的输入输出文件,虽然源头上是molclus生成的,但是是molclus调用高斯、由高斯生成的,所以叫做高斯的输入输出文件。
问题在于你的高斯版本太低,不支持色散校正。仔细阅读http://sobereva.com/210
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

5

帖子

0

威望

53

eV
积分
58

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-22 16:10:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-22 16:06
你上传的就是高斯的输入输出文件,虽然源头上是molclus生成的,但是是molclus调用高斯、由高斯生成的,所 ...

嗯嗯,感谢您的解答,我升级一下高斯版本

5

帖子

0

威望

53

eV
积分
58

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-22 16:37:52 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-22 16:03
你用了Gaussian 09 C,不支持DFT-D3,建议升级到Gaussian 09 D以上
http://sobereva.com/210

感谢您的解答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 17:24 , Processed in 0.172376 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list