2022双十一MD工作站配置推荐

Entropy.S.I

前两天发了《性能翻倍？RTX4090科学计算之经典MD模拟全面测试》，简单提了一下硬件采购方面的建议，但没有写具体的配置。

今天发现近期有朋友在我去年发的《2021双十一MD工作站配置推荐》底下提到希望推荐一下今年的配置，于是看了一下行情，发现大量配件缺货（似乎老黄清完3070、3080Ti、3090的库存了…？），连CPU都有缺货情况，所以一开始是决定不推荐今年的版本，不过后来想到之前公社群聊里有一些朋友也在说买不起4090、想装一套便宜点的MD机器，所以我又仔细看了一圈，发现确实能凑出一套勉强值得推荐的万元中端配置，遂把这套配置和RTX 4090的“空气”配置一同发出来。配置是针对GMX写的，毕竟AMBER用户也可能会用到GMX，这俩软件在功能上可以互补。



目前RTX 3080全新的货源似乎还算充足，所以推荐了RTX 3080。用AMD Ryzen R7 5700X可能不能较完整地发挥出RTX 3080的性能，但其胜在主板+CPU很便宜。而且5800X没货，5900X这种双CCD的CPU用于GPU加速GMX比较吃亏，intel 12490F性能又过低了。

虽然社长一再说跑MD的机器理论上不需要SSD，但个人认为装个SSD用于放操作系统和软件还是有必要的。对于4090这种顶级机器，整机都2万多了，确实不差几百元的SSD钱，而且加一块容量稍大、读写性能强的SSD也可以用于一些临时性数据的存放。比如有时需要自己写脚本对很长一段轨迹的某一数据以块平均方式计算误差，要并行处理轨迹，此时先把轨迹载入SSD或直接在跑MD时把轨迹写在SSD上就有明显优势。

大容量机械硬盘很重要，MD轨迹很占空间，一般短期内也没法删掉这些轨迹，等文章发出来或项目结题才敢删掉一部分已经没用的轨迹。

先马朱雀AIR不带风扇，配置单里的3把风扇建议装到后面和顶上。

10039元的这套配置，基本上是把能省的钱都省了，如果这几天有货且价格没啥变动，可以直接抄。

尽量早买，目前行情瞬息万变……

xptracy

cpu如果换成7950x主板选哪款好，其他都不用动吧

wjc404

不好意思问一下，去年的配置单里面有ECC内存，今年的没有，是因为缺货吗？以及英伟达好像只有quadro/tesla专业卡以及极少数顶级游戏卡才有ECC显存，蛮恶心的。

Entropy.S.I

xptracy 发表于 2022-11-2 19:55
cpu如果换成7950x主板选哪款好，其他都不用动吧

内存得用DDR5，金士顿FURY DDR5 5200MT/S 16G*2套条，999。还想跑Gaussian啥的话，加钱用5600MT/s 32G*2乃至*4。

主板用个华硕TUF X670E-PLUS就够，去AMD JD自营店看看，板U套装6899。想进一步省钱，就用TUF B650M-PLUS WiFi（非WiFi目前没7950X套装），板U套装6049。

这些硬件还有很大降价空间，不是非常非常急就等等。

Entropy.S.I

wjc404 发表于 2022-11-2 20:17
不好意思问一下，去年的配置单里面有ECC内存，今年的没有，是因为缺货吗？以及英伟达好像只有quadro/tesla ...

因为现在非ECC的DDR4明显比ECC便宜了，就没必要强求ECC了。而且去年自己买了以后发现tb上DDR4ECC多是寨条，不敢再推荐…（不止ECC-UDIMM，那些RECC也基本都是寨条，哪怕是标榜“原厂”的，其实都是文字游戏，只是原厂颗粒，实际是不明来历的小厂组装的）

另外所有DDR5内存自带On-die ECC。

最后，4090显存有ECC。

admiralt

您好，想请教下cpu选择问题。我现在有一张3080ti，想配一个cpu,5900x可不可以？5800x的性能大概会降低多少？
因为看您说5900x的双ccd比较吃亏，有点好奇这个影响有多大。
感谢！

Entropy.S.I

admiralt 发表于 2022-11-3 04:11
您好，想请教下cpu选择问题。我现在有一张3080ti，想配一个cpu,5900x可不可以？5800x的性能大概会降低多少 ...

5800X就行，比5900X弱得有限。JD自营盒装没货，能接受的话，上tb靠谱店买散片+B550板U套装也行，比5700X的贵几百。

exity

感觉楼主在电源策略上略微激进了。
我不堆个2*最大功率的瓦数都不踏实。

Entropy.S.I

exity 发表于 2022-11-3 08:28
感觉楼主在电源策略上略微激进了。
我不堆个2*最大功率的瓦数都不踏实。

4090功耗很低，用过就知道，PL拉到600W并超频150MHz跑起MD来最多470W，大部分情况下只有400W出头。我之前跑的测试中第一轮由于对面协助我的兄弟一时疏忽，用了850W电源，但这轮测试也能稳定跑完（5小时），反而3090超频一跑就过载，也是这时才发现的用错电源。

第二个配置5700X功耗低，配3080用750W就足够。

exity

Entropy.S.I 发表于 2022-11-3 08:42
4090功耗很低，用过就知道，PL拉到600W并超频150MHz跑起MD来最多470W，大部分情况下只有400W出头。我之前 ...

原来如此
最近总是看到40系列的插口热化了的新闻，就先入为主的觉得它功耗爆表。

Entropy.S.I

exity 发表于 2022-11-3 08:45
原来如此
最近总是看到40系列的插口热化了的新闻，就先入为主的觉得它功耗爆表。

这个问题确实很大，所以不着急建议等等。原生12VHPWR线估计没有这个问题，但对应的电源现在完全没货，海韵新发布的VERTEX系列也要年底才出货。

admiralt

Entropy.S.I 发表于 2022-11-3 08:08
5800X就行，比5900X弱得有限。JD自营盒装没货，能接受的话，上tb靠谱店买散片+B550板U套装也行，比5700X ...

好的，非常感谢！

zongxupeng

请教一下13600KF有性价比吗？

Entropy.S.I

zongxupeng 发表于 2022-11-3 18:43
请教一下13600KF有性价比吗？

只跑AMBER之类的纯GPU软件的话，可以用13600KF配2块4090，第二块4090可能要用PCIe延长线。13600KF用TUF Z790主板就行了

xptracy

Entropy.S.I 发表于 2022-11-3 09:07
这个问题确实很大，所以不着急建议等等。原生12VHPWR线估计没有这个问题，但对应的电源现在完全没货，海 ...

4090要选择12VHPWR或者atx3.0的吗？