求助：如何求分子与界面法线的夹角

王纪峰 · 发表于 Post on 2022-12-4 16:35:40

朋友们好！我模拟了分子（离子液体）在界面（Li金属）上的行为，现在想统计分子与界面法线之间夹角，我现在只了解gmx angle进行角度统计..但是这仅限于二面角和分子内的键角...请问是否存在一种合适的方法，来统计分子与界面法线之间夹角的关系呢？感谢好心人回答！！

lyj714 · 发表于 Post on 2022-12-4 16:48:37

vmd写tcl脚本，遍历分子计算夹角

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[GROMACS] 求助：如何求分子与界面法线的夹角