分子动力学模拟中有没有体系有序度的描述符或者物理量？

wangyueda · 发表于 Post on 2022-12-5 19:59:53

请问下各位老师，在分子动力学模拟中，有没有相关的描述符或者物理量可以表征体系的有序度，比如常温下的水有序度要比低温下的水有序度要低（结冰有序度升高），体系总偶极矩的平方<M>2可以吗？

牧生 · 发表于 Post on 2022-12-5 21:27:49

我只晓得f3和f4序参数，挺方便

wangyueda · 发表于 Post on 2022-12-5 22:03:53

牧生发表于 2022-12-5 21:27
我只晓得f3和f4序参数，挺方便

能给个相关介绍的博文或者文献吗谢谢老师

牧生 · 发表于 Post on 2022-12-6 08:48:53

wangyueda 发表于 2022-12-5 22:03
能给个相关介绍的博文或者文献吗谢谢老师

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Lacrimosa · 发表于 Post on 2022-12-7 09:41:00

描述有序性的参数很多，水以及冰中常用的有tetrahedrality order parameters，bond order parameters，chill+等方法，其中第一个可以直接用gmx hydrorder计算，第二个可以通过pyscal.py计算，最后一个可能需要自己写程序。近年也有很多新的方法被开发出来，看这篇综述可以大概了解一下：Revealing key structural features
hidden in liquids and glasses

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[综合交流] 分子动力学模拟中有没有体系有序度的描述符或者物理量？

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