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[新手求助] g09B01/l1002.exe 错误

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这是输出和输入文件
l1002错误怎么解决?谢谢!

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发表于 Post on 2016-6-2 17:21:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 冰释之川 于 2016-6-3 08:15 编辑

---------------------------- 楼主的输入-----------------------
#p opt=(calcfc,ts,maxcycle=500,noeigentest,tight) freq(noraman) b3pw91/6-31g(d,p) maxdisk=80GB iop(1/8=10) scf=maxcycle=500  
-----------------------------------------------------------------


先谈谈令人发指的关键词书写:
(1)opt中的 maxcycle 一般不用设,maxcycle =XXX 很多情况下无助于处理问题;scf=maxcycle 也一样。
(2)freq 在DFT中默认就是 noraman,写它干甚?
(3)为什么要加iop(1/8=10) ?  IOp(1/8=N) 在优化的时候以N*0.01 bohr/弧度为最初置信半径,如果优化中不动态更新置信半径,则每一步步长都不会大于这个值(并非是必须等于这个值)。减小其数值有助于解决收敛震荡问题,如果势能面平缓,则应当加大以加快优化速度。默认是30。等价于opt关键词中maxstep选项。【如非必要,不要随意加iop


下面讲讲正题:

NIJ > Max2 in MMCore.
Error termination via Lnk1e in /vol6/home/hn_zjl/software/Gaussion09/g09B01/l1002.exe
高斯官方给的答复是:

A memory allocation bug for very large systems, which could cause a failure with the message “NIJ > Max2 in MMCore,” was fixed
解决:换G09C01或更新的版本

-----------------建议先删去冗余关键词再开始计算-----------------------
#p b3pw91/6-31g(d,p) opt=(calcfc,ts,noeigentest) freq  maxdisk=80GB
--------------------------------------------------------------------------------
Update: 感谢四楼的提醒,加上calcfc





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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-2 21:59:31 | 只看该作者 Only view this author
按照你给的关键词交了作业,都交不了作业,马上就结束了。
Error termination via Lnk1e in /public/software/Gaussian09/g09B01/l1.exe

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发表于 Post on 2016-6-2 22:19:12 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-2 21:59
按照你给的关键词交了作业,都交不了作业,马上就结束了。
Error termination via Lnk1e in /public/soft ...

他给的关键词里 opt=(ts,calcfc,noeigen) 中漏写了calcfc ,这个是过渡态计算必须的

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冰释之川 + 3 我很赞同

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-3 08:19:00 | 只看该作者 Only view this author
nkallwar 发表于 2016-6-2 22:19
他给的关键词里 opt=(ts,calcfc,noeigen) 中漏写了calcfc ,这个是过渡态计算必须的

加上这个关键词后还是不行,交不上作业。
还有没有什么办法解决这个问题呀?

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发表于 Post on 2016-6-3 13:45:10 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-3 08:19
加上这个关键词后还是不行,交不上作业。
还有没有什么办法解决这个问题呀?

贴出输出文件信息
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-4 09:08:47 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2016-6-3 13:45
贴出输出文件信息

这是你给的关键词后的输出文件

5-dft-ts1-1.log

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发表于 Post on 2016-6-4 09:44:15 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-4 09:08
这是你给的关键词后的输出文件

opt=(ts,calcfc,no

请用 英文输入法打入“,” 不要直接复制!

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sobereva + 1 真难以想象会犯这种错误

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-5 16:02:19 | 只看该作者 Only view this author
恩,按照这个关键词还是同样的错误,而且更改g09版本行不通,还有没有其它的办法解决这个问题?谢谢!
这是输出文件

5-dft-ts1-1.log

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发表于 Post on 2016-6-5 16:36:33 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-5 16:02
恩,按照这个关键词还是同样的错误,而且更改g09版本行不通,还有没有其它的办法解决这个问题?谢谢!
这 ...


12核机子才给800MB内存?太小了!
能给多大给多大,还有这个问题传上D.01版的输出文件。
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发表于 Post on 2016-6-6 03:31:23 | 只看该作者 Only view this author
过渡态我也不怎么懂,就是看了ExpChem2和3上的一些例子,但看到象你这样的体系,这过渡态初猜是怎么得到的?我感觉这也太困难了吧?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-6 08:40:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-5 16:36
12核机子才给800MB内存?太小了!
能给多大给多大,还有这个问题传上D.01版的输出文件。

内存的设置是根据什么来设定的?
设多大又是根据什么,我从哪里可以知道我可以给多大设多大?

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发表于 Post on 2016-6-6 09:46:14 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-6 08:40
内存的设置是根据什么来设定的?
设多大又是根据什么,我从哪里可以知道我可以给多大设多大?


机子有多少物理内存总应该知道
不知道就用top来看
如果没跑其它任务就留3G给系统,其它都给高斯
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-6 15:44:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-6 09:46
机子有多少物理内存总应该知道
不知道就用top来看
如果没跑其它任务就留3G给系统,其它都给高斯

这是我机子的物理内存,我应该设多大?没跑其它任务

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发表于 Post on 2016-6-6 15:49:09 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2016-6-6 15:44
这是我机子的物理内存,我应该设多大?没跑其它任务

32032M 31个G多  给上十几二十个G都没有关系的……为什么只给人家800M……

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