用VMD显示蛋白质分子的二级结构与PDB库中的结构有时有不少差别，请教各位原因！

huhq · 发表于 Post on 2023-1-10 08:40:30

本帖最后由 huhq 于 2023-2-27 17:24 编辑

PDB数据库中1G1C蛋白结构如下：

2ns动力学平衡后1G1C蛋白结构如下（经mol ssrecalc top命令渲染）：

乐平 · 发表于 Post on 2023-1-10 11:16:37

本帖最后由乐平于 2023-1-10 11:21 编辑

你这样提问，没人能回答……

什么蛋白质？什么差别？至少把你在 VMD 里显示的和 PDB 网页显示的分别截图，标记处你认为有差别的地方。这样别人才能看到你所谓的差别啊。

用营销号的方式打个比方：“这个男人叫小帅，另一个男人叫大壮，他们俩有差别。你怎么看？”
谁知道你说的小帅，大壮长什么样啊？

Acee · 发表于 Post on 2023-1-12 13:28:38

标题一行话，内容全靠猜，怎么回答你呢

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[VMD] 用VMD显示蛋白质分子的二级结构与PDB库中的结构有时有不少差别，请教各位原因！

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