计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2342|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] Molclus调用Gaussian进行DFT计算显示不工作

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

65

eV
积分
78

Level 2 能力者

求助:我跟曾经一位同学的问题相同,但是并没有在他的帖子内找到答案,希望各位老师能帮我看看,提出宝贵意见!感谢!!!     我通过“genmer:生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具” ,已经成功进行的团簇结构搜索,生成xyz文件,我按照教程将genmer生成的xyz文件放在了molclus目录下。调用gaussian进行DFT计算,但多次调试模板文件以及setting文件,仍显示调用高斯错误。以下是错误提醒,我也附上了我的相关文件,希望能帮我找出错误。
由于多次尝试错误,我将团簇及分子数量改写成比较少作为例子进行试试验。
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file

我本专业是能源与动力工程,对量子化学这部分的知识知之甚少,希望各位老师不吝赐教!感谢老师!!!




template.gjf

104 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 11

template2.gjf

118 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

traj.xyz

2.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

settings.ini

2.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

13

帖子

0

威望

65

eV
积分
78

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-11 21:03:54 | 只看该作者 Only view this author
中途产生的gau.gjf和gau.out已上传

gau.gjf

716 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

gau.out

4.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

3#
发表于 Post on 2023-1-11 21:20:05 | 只看该作者 Only view this author
花露水 发表于 2023-1-11 21:03
中途产生的gau.gjf和gau.out已上传

你用本子算,内存给太大算不了。
另外,建议改6-31G为6-31G*并加em=gd3bj。去掉nosymm。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

13

帖子

0

威望

65

eV
积分
78

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-11 22:12:50 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-1-11 21:20
你用本子算,内存给太大算不了。
另外,建议改6-31G为6-31G*并加em=gd3bj。去掉nosymm。

我按照您的方法试验了一下 还是不行 麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: No such file or directory
Error: This Gaussian task did not perform geometry optimization at all! Please check if you omitted "opt" keyword or there is any problem in the template file


111113.png (96.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

111113.png

template2.gjf

123 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

template.gjf

109 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

gau.out

4.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

gau.gjf

720 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 5

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

5#
发表于 Post on 2023-1-11 23:07:27 | 只看该作者 Only view this author
花露水 发表于 2023-1-11 22:12
我按照您的方法试验了一下 还是不行 麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: N ...

可能是版本问题。我用Gaussian 09 D跑没问题。你用了Gaussian 09 C. 将Opt(MaxCyc=n)换成OptCyc=n看看。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125148

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2023-1-12 06:10:00 | 只看该作者 Only view this author
花露水 发表于 2023-1-11 22:12
我按照您的方法试验了一下 还是不行 麻烦您再帮我看看

Thread and Process ID are zero in wsystem: N ...

%mem=20MB给的也太抠门了
仔细看下文关于内存分配的说明
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
内存给得太小会导致很多情况程序都没法正常计算

你当前用的G09 C.01不支持D3校正,G09 D.01开始才支持,下文说了
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

用更新版本Gaussian。如果只能用这个版本,B3LYP em=gd3bj改成wB97XD。对于算这类问题性价比会低一些,但也完全合理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 19:46 , Processed in 0.190480 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list