计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1635|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 请问ccpv5z仍有明显bsse正常吗?

[复制链接 Copy URL]

309

帖子

0

威望

2026

eV
积分
2335

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
为了怼审稿人bsse问题做的测试计算,以为ccpv5z bsse趋近于0了,结果比def2qzvp还要大一点。请问这个正常吗?

Table. Results of Calculated Binding Energy (electron energy, kcal/mol) using Different Basis Sets with PBE0-D3(BJ) Functional
6-311G**
Def2qzvp
Cc-pv5z
Binding energy without BSSE
33.71
32.34
33.05
BSSE correlation
7.35
0.36
0.47
The calculation results reveal that the BSSE correlation would bring much larger error for 6-311G** basis set calculation. These results suggest that BSSE is not appropriate for this work, and introducing BSSE correlation cannot improve the accuracy of DFT calculations.

4289

帖子

4

威望

9554

eV
积分
13923

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2023-1-17 11:18:25 | 只看该作者 Only view this author
如果是闭壳层体系,倒也没什么异常的。不过你这最后一句英文咋说的与事实相反呢。。。表格里的数据恰恰说明6-311G(d,p)基组小了,对这个基组一定要考虑BSSE。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

194

帖子

0

威望

3694

eV
积分
3888

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2023-1-17 11:20:39 | 只看该作者 Only view this author
BSSE correlation是什么意思?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-1-17 11:35:57 | 只看该作者 Only view this author
修正BSSE的方法不唯一,常用的counterpoise方法本身不是原理上严格的,所以拿它给出的BSSE校正量来评判基组质量或者真实的BSSE的大小本身就是不确切的,特别是对于本来质量就很高的基组而言
真正应该关心的并不是counterpoise方法给出的BSSE校正量是多大,而关键是看结果与CBS相差多大
既然cc-pV5Z都算得动,应当以QZ->5Z做CBS外推的结果作为精确值来评判各个基组在计算相互作用能方面的基组不完备性误差
对于DFT,外推的情况和基于波函数的方法有一定差异,讨论见J. Chem. Theory Comput., 16, 5712 (2020)。对于当前用的PBE0-D3(BJ)来说,defe2-QZVP的结果直接就可以当做BSSE可以忽略了(较真一点可以用ma-def2-QZVP),至少此时BSSE对相互作用能造成的误差已远低于这类理论方法本身的误差,没有纠结的必要。

BSSE correlation 应当为BSSE correction

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

309

帖子

0

威望

2026

eV
积分
2335

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-17 12:56:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-1-17 11:35
修正BSSE的方法不唯一,常用的counterpoise方法本身不是原理上严格的,所以拿它给出的BSSE校正量来评判基组 ...

谢谢老师。
这只是模型体系的比较值。实际体系都是用6-311G**计算得到的,
之所以用6-311G**就是因为 在模型测试中,结合能结果跟 def2qzvp结果比相差不大(如表所示都在33kcal/mol左右)
实际体系用def2qzvp是算不动的。

做这个比较的目的是审稿人提出了bsse的质疑,希望我们重算,我只好那这个比较来证明 6-311G**条件下得到的bsse校正值过大只会带来更大的误差。

194

帖子

0

威望

3694

eV
积分
3888

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2023-1-17 13:52:07 | 只看该作者 Only view this author
从模型系统的结果可能可以说,对这种系统和计算水平,6-311G**的基组不完备误差抵消了BSSE,所以不算cp效果好一些

327

帖子

2

威望

2813

eV
积分
3180

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2023-1-17 14:13:47 | 只看该作者 Only view this author
gauss98 发表于 2023-1-17 12:56
谢谢老师。
这只是模型体系的比较值。实际体系都是用6-311G**计算得到的,
之所以用6-311G**就是因为  ...

用ORCA算def2qzvp算不动吗,是你机器内存不够还是体系原子数太多了?正常两三百原子没啥问题吧

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125181

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2023-1-19 08:00:08 | 只看该作者 Only view this author
gauss98 发表于 2023-1-17 12:56
谢谢老师。
这只是模型体系的比较值。实际体系都是用6-311G**计算得到的,
之所以用6-311G**就是因为  ...

即便是模型体系6-311G**结果和def2-QZVP结果差不多,也不意味着对于实际研究的体系也有这样的结论。大概率只是模型体系下恰好结果差不多而已,除非用一堆模型体系进行测试,否则结论不具备普遍性。

普通泛函DFT级别下要获得还算定量准确的弱相互作用,起码6-311+G(d,p)结合counterpoise
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 23:27 , Processed in 0.199335 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list