计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1573|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] 运用molclus,没有输出cluster.xyz文件

[复制链接 Copy URL]

60

帖子

0

威望

547

eV
积分
607

Level 4 (黑子)

本帖最后由 qjy111 于 2023-2-27 09:22 编辑

启动isostat,回车三次后没有输出cluster.xyz文件
高斯路径是gaussian_path= "F:\GS\G09W\g09.exe"  // Command for invoking Gaussian

72

帖子

0

威望

2338

eV
积分
2410

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-2-25 22:48:10 | 只看该作者 Only view this author
你的结构优化没有完成吧。
优化好坐标和能量会写入到当前目录下的isomers.xyz文件中,你的isomers.xyz文件是0KB,里面没有优化好的坐标。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-2-26 03:34:47 | 只看该作者 Only view this author
仔细看molclus运行过程在屏幕上给出的超级明确的提示,弄清楚发生了什么
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

21

帖子

0

威望

321

eV
积分
342

Level 3 能力者

4#
发表于 Post on 2023-2-26 10:54:03 | 只看该作者 Only view this author
看一下setting.ini里的ipause这行,个人是改成了ipause= 0,这样即使一个构型优化失败也会继续优化下一个,直到把所有的都跑一遍。

60

帖子

0

威望

547

eV
积分
607

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-27 09:20:09 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qjy111 于 2023-2-27 09:55 编辑
sobereva 发表于 2023-2-26 03:34
仔细看molclus运行过程在屏幕上给出的超级明确的提示,弄清楚发生了什么

我刚新添加了图片,好像是高斯路径这里错了,因为文件到高斯这里就结束了

60

帖子

0

威望

547

eV
积分
607

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-27 09:23:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qjy111 于 2023-2-27 09:56 编辑
w5326178 发表于 2023-2-26 10:54
看一下setting.ini里的ipause这行,个人是改成了ipause= 0,这样即使一个构型优化失败也会继续优化下一个, ...

我刚新添加了图片,我改成1和0都在高斯这里结束,感觉是路径这里错了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 05:13 , Processed in 0.185485 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list