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[新手求助] 两个阴离子在溶剂中的结构优化问题

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本帖最后由 Lemon97z 于 2023-3-15 15:27 编辑

我想计算Na+与溶剂(两个阴离子+一个中性分子)的解离能  在对于 两个阴离子+一个中性分子 的优化过程,在真空下优化会相隔无限远而报错,然后我取Na+和溶剂优化后的结构,仅把Na+删去,加了溶剂模型后就可以计算,具体参数为:“opt=calcfc freq b3lyp/6-31+g(d) scrf=iefpcm em=gd3bj ”   ,但是能量变化始终不大,我想问这样计算的结果可以接受吗? 这种情况应该怎么计算才最合适呢?

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1.png

sol.gjf

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溶剂输入文件

Na -sol_out文件.rar

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Na+溶剂out文件

Na -sol.gjf

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Na+溶剂输入文件

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发表于 Post on 2023-3-15 11:45:35 | 只看该作者 Only view this author
你要算Na+和溶剂分子形成的复合物在真空中解离的解离能,还是Na+与溶剂分子在溶液中的解离能?第一种能算,第二种不好定义解离能,也不好算解离能,因为溶剂中Na+不是孤立存在,总是溶剂化的。
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发表于 Post on 2023-3-15 11:49:13 | 只看该作者 Only view this author
至少直接贴每个任务的输入文件,结构都不知道你怎么摆的,也不知道你具体怎么设的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-15 15:22:06 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-3-15 11:45
你要算Na+和溶剂分子形成的复合物在真空中解离的解离能,还是Na+与溶剂分子在溶液中的解离能?第一种能算, ...

我是想算在真空中的解离能,但是结构优化不成功

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-15 15:26:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-15 11:49
至少直接贴每个任务的输入文件,结构都不知道你怎么摆的,也不知道你具体怎么设的

我上传了老师,我是拿 Na+-溶剂优化后的结构,把Na+删去 来作为溶剂优化的初始结构,但是计算完后,我看结构没什么变化

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发表于 Post on 2023-3-15 16:20:36 | 只看该作者 Only view this author
Lemon97z 发表于 2023-3-15 15:22
我是想算在真空中的解离能,但是结构优化不成功

这个体系算Na+和溶剂分子的解离能不好算。如果你算简单的AB ->A + B或者(AlCl4-) -> AlCl3 + (Cl-) 是好算的,但是你的体系有好几种溶剂分子(离子液体吗?),这几个分子构象又很多,而且相互间还有作用,如果你把Na+挪走,剩下的体系要优化到什么构象?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-15 16:48:50 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2023-3-15 16:20
这个体系算Na+和溶剂分子的解离能不好算。如果你算简单的AB ->A + B或者(AlCl4-) -> AlCl3 + (Cl-) 是好 ...

对的 是离子液体,我实际上是想把这些溶剂分子看作一个整体,然后考虑他们和Na+的解离能,只是优化这部分有些问题

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发表于 Post on 2023-3-15 17:07:10 | 只看该作者 Only view this author
Lemon97z 发表于 2023-3-15 16:48
对的 是离子液体,我实际上是想把这些溶剂分子看作一个整体,然后考虑他们和Na+的解离能,只是优化这部分 ...

溶液整体是不好定义解离能的,因为溶液中没有孤立的Na+,都是溶剂化的,溶剂化自由能也不同于解离能,因为溶剂化能还包括在溶液中形成空腔(以容纳Na+)的能量。
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