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[Multiwfn使用咨询] Centos7免root安装Multiwfn的方法

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本帖最后由 Freeman 于 2023-3-15 18:58 编辑

安装Multiwfn需要安装motif库,而motif库在centos7上要用yum命令安装。如果你在用的是公共服务器,没有root权限,就用不了yum。我试出了以下方法绕过这个难题。以下用***指代Multiwfn的版本号。

1、进入你的家目录
  1. cd
复制代码

2、解压Multiwfn,给程序加上执行权限
  1. unzip Multiwfn***.zip
  2. cd Multiwfn***
  3. chmod 750 -R Multiwfn
复制代码

3、输入命令
  1. cd (回到家目录)
  2. rpm2cpio http://mirror.centos.org/centos/7/os/x86_64/Packages/motif-2.3.4-14.el7_5.x86_64.rpm | cpio -idvm
  3. rpm2cpio http://mirror.centos.org/centos/7/os/x86_64/Packages/libXp-1.0.2-2.1.el7.x86_64.rpm | cpio -idvm
复制代码
这会在你当前目录下创建你自己用的/usr文件夹,在里面装motif和libXp。这里为什么有个libXp呢?社长的安装教程视频里只展示了怎么装motif。但是我如果不装libXp的话,就会报缺libXp的so文件。可能用yum命令装motif就会自动装上libXp,而上述网页的motif***.rpm里则不包含libXp,需要再单独安装。

4、在~/.bashrc设置环境变量
  1. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/usr/lib:~/usr/lib64
  2. export Multiwfnpath=~/Multiwfn***
  3. export PATH=$PATH:$Multiwfnpath
复制代码
重启终端(光source可能还不够)。


完成。

注意一般服务器都没有图形界面,所以不能用对话框选文件,不能看轨道,不能看图。


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发表于 Post on 2023-3-15 19:21:15 | 只看该作者 Only view this author
访问这个
https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm
里面有一个我弄好的,下载。

看这里,
https://docs.sylabs.io/guides/3. ... setuid-installation
不需要root,安装singularity / apptainer

然后就可以用了。
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https://labitc.top
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发表于 Post on 2023-3-15 20:02:16 | 只看该作者 Only view this author
如果不用到Multiwfn图形相关功能,建议装Multiwfn的noGUI版,不需要装任何额外的库

另外,Multiwfn运行环境需要按照手册2.1.2节进行恰当配置,否则处理一些占内存多的情况会崩溃
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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发表于 Post on 2023-3-15 23:46:54 | 只看该作者 Only view this author
这样做只能避免Multiwfn在启动时报错,所以如果用不到(或者用不了)Multiwfn的图形相关功能,还是按社长建议装Multiwfn的noGUI版比较好。

另外,即使服务器有图形界面,按1楼的方法仍然有可能看不了分子和轨道,但选文件和看光谱还是能做到的。
「狩りってのは先に焦せった方の負けだ、ハンターも獲物もな」

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