计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1485|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Gaussian计算Hf团簇无法正常完成,报错提示内存溢出

[复制链接 Copy URL]

60

帖子

0

威望

1160

eV
积分
1220

Level 4 (黑子)

各位老师大家好,用Gaussian16算一个Hf团簇,但是计算始终没有正常运行下去。也没有显示正常的高斯报错信息,已经试了好久,求助大家帮忙看看!感谢!
slurm-26744687.out (1.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)
hcp3.com (5.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)
hcp3.log (135.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)




202303302257085267..png (55.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202303302257085267..png

202303302258219870..png (66.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202303302258219870..png

211

帖子

0

威望

572

eV
积分
783

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2023-3-31 17:58:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2023-3-31 18:32 编辑

看上去cpscf收敛不了。首先检查最近一个几何结构的scf收敛情况以及波函数是否稳定,可以写以下的输入文件然后本地运行:
  1. %chk=hcp3_scf.chk
  2. %oldchk=hcp3.chk
  3. # b3lyp chkbasis stable=opt guess=read geom=allcheck
复制代码

如果发现波函数原本就是稳定的,可以再尝试提高积分精度,把g09defaults关键词去掉(再不行就写cphf=grid=fine)。如果还是不行,大概就只能去掉recalc关键词以及用freq=numer以规避cpscf计算。
(说点题外的,B3LYP对Hf是否合适,可能需要找找benchmark的文章看看)

2425

帖子

1

威望

6196

eV
积分
8641

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-3-31 18:06:01 | 只看该作者 Only view this author
读写空间不足。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

455

帖子

1

威望

2929

eV
积分
3404

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2023-3-31 18:09:37 | 只看该作者 Only view this author
和内存无直接关系,是硬盘写满了,分清硬盘和内存。另外28核只给10GB内存确实太抠门了。

2425

帖子

1

威望

6196

eV
积分
8641

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2023-3-31 18:30:43 | 只看该作者 Only view this author
No space left on disk是没有磁盘空间了
Out of memory ,是内存不足。
内存溢出,是个十分严重的问题,你又不写程序,怎么会遇到这个错误?
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

60

帖子

0

威望

1160

eV
积分
1220

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-31 23:28:25 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2023-3-31 18:30
No space left on disk是没有磁盘空间了
Out of memory ,是内存不足。
内存溢出,是个十分严重的问题, ...

用的是装在学校服务器上的高斯,我问问管理员吧

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125148

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2023-4-1 09:42:26 | 只看该作者 Only view this author
这不叫Hf团簇,而叫含多个Hf的多核过渡金属配合物
用B3LYP没好处,PBE0是更好选择,看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

g_write是硬盘的存Gaussian临时文件的空间写满了所致

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 02:47 , Processed in 0.171801 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list