请教使用OPLS力场缺少Al原子参数

xuming · 发表于 Post on 2023-4-21 19:22:24

最近想模拟关于Al/PEG的聚合物电解质，建立力场文件时缺少Al-O的参数，请问这种情况如何处理，如果换力场的话，这种体系应该适合那种电场？

牧生 · 发表于 Post on 2023-4-21 21:56:50

amber+gaff是最佳的选择。用sobtop来生成top文件，再也不能更傻瓜化了。
http://sobereva.com/soft/Sobtop/

xuming · 发表于 Post on 2023-4-24 15:39:15

牧生发表于 2023-4-21 21:56
amber+gaff是最佳的选择。用sobtop来生成top文件，再也不能更傻瓜化了。
http://sobereva.com/soft/Sobtop ...

您好，想再请问您一下使用sobtop后指认gaff时没有Al原子类型，然后自动指认了UFF原子类型，请问这样可以吗？
另外在指认计算MMFF94原子电荷时失败，想请教一下如何解决

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