使用aocc+aocl从头编译使用openmpi的vasp6

biogon · 发表于 Post on 2023-5-11 14:40:27

本帖最后由 biogon 于 2024-1-29 10:33 编辑

看到坛里有用amd官方给的用spack编译vasp的速度不理想的帖子，写个从头用aocc+aocl编译vasp的教程。
现在先随便写点，很多细节等以后补充。
1. 安装aocc和aocl
在amd官网下载3.2.0版本的aocc和aocl并安装（细节有时间再写）
4.1/4.0版本可用于编译vasp6.3.2以后的版本
安装好后需要添加环境变量，使在命令行中输入flang/clang有输出

aocl需要下载基于aocc构建的版本

2. 编译基于aocc3.2.0的openmpi（4.1.4版本）
编译过程基本与正常编译openmpi无异，区别就是在configure时要添加

CC=clang CXX=clang++ FC=flang

复制代码

3. 编译vasp
makefile（纯mpi）在下面已经提供，自己用只要修改里面的所有的

/opt/apps/amd/aocl/3.2.0

复制代码

为自己安装的aocl路径即可
cpu架构选项

VASP_TARGET_CPU ?= -march=znver2

复制代码

改成自己的cpu类型（1 2 3 or 4）

带VTST，VASPsol， Wannier90， HDF5可正常编译出，DFT-D4无法编译出

别的细节等有时间再补充

12.19更新
比较新的openmpi使用时configure需要使用编译器绝对路径，不然编译会报错
./configure CC=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/clang CXX=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/clang++ FC=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/flang --prefix=$安装路径

1.29
实测编译使用aocc4.1.0编译openmpi5.0.x，系统gnu编译器版本最低为11，否则编译就报错

ggshining · 发表于 Post on 2024-1-26 22:52:53

biogon 发表于 2024-1-26 14:57
版本呢

问题解决了，还是gcc的问题，装完aocc要用clang clang++ flang -v看下三者自动识别的gcc位置是否正确，我的就是flang自动找的gcc位置与前两个的gcc11不对应。把系统中多的gcc版本删掉或者重命名掉文件夹就好了

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 16:21:13

先来支持一波，马上编译试试看

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 18:17:02

本帖最后由 chever 于 2023-5-11 18:18 编辑

请教一下，楼主编译的vasp版本是6.几。我编译6.2.0出现unknown argument: '-zenver2'

biogon · 发表于 Post on 2023-5-11 18:58:54

chever 发表于 2023-5-11 18:17
请教一下，楼主编译的vasp版本是6.几。我编译6.2.0出现unknown argument: '-zenver2'

6.3，不认的话这个注释掉应该就行了

chever · 发表于 Post on 2023-5-12 11:43:14

biogon 发表于 2023-5-11 18:58
6.3，不认的话这个注释掉应该就行了

感谢楼主，已成功编译。在手头算的一个体系里面比Intel Parallel Studio XE 2019编译的vasp.5.4.4+加速代码还要快20%

wypkdhd · 发表于 Post on 2023-5-24 22:37:24

chever 发表于 2023-5-12 11:43
感谢楼主，已成功编译。在手头算的一个体系里面比Intel Parallel Studio XE 2019编译的vasp.5.4.4+加速代 ...

请教下层主你的cpu是哪个？什么体系用多少个核快了百分之20？可否告知具体的电子步时间差异。

chever · 发表于 Post on 2023-5-25 09:14:25

wypkdhd 发表于 2023-5-24 22:37
请教下层主你的cpu是哪个？什么体系用多少个核快了百分之20？可否告知具体的电子步时间差异。

7R32，非严谨测试vasp 6.3版本下48核跑5*5*4 Ni(111)，相比xe2020编译的电子步从20s减少到16s左右

wuy069 · 发表于 Post on 2023-5-25 14:36:11

chever 发表于 2023-5-11 18:17
请教一下，楼主编译的vasp版本是6.几。我编译6.2.0出现unknown argument: '-zenver2'

VASP_TARGET_CPU ?= -march=znver2

wypkdhd · 发表于 Post on 2023-5-25 15:09:50

本帖最后由 wypkdhd 于 2023-5-25 15:10 编辑

chever 发表于 2023-5-25 09:14
7R32，非严谨测试vasp 6.3版本下48核跑5*5*4 Ni(111)，相比xe2020编译的电子步从20s减少到16s左右

我邮箱wypkdhd@163.com，方便了把incar和poscar发我，我拿我的7543也测试下。方便了把您那边20s和16s两个outcat也发给我，我刚好测试完能补充下帖子。

JiangZiya · 发表于 Post on 2023-5-31 16:52:21

请问楼主，这个编译方法是针对AMD CPU的吗，Intel的CPU是否可用，如果可以，需要修改什么吗

biogon · 发表于 Post on 2023-5-31 20:34:32

JiangZiya 发表于 2023-5-31 16:52
请问楼主，这个编译方法是针对AMD CPU的吗，Intel的CPU是否可用，如果可以，需要修改什么吗

Intel的CPU用oneapi编译

JiangZiya · 发表于 Post on 2023-5-31 22:08:38

biogon 发表于 2023-5-31 20:34
Intel的CPU用oneapi编译

我参考卢天老师的帖子用oneAPI编译过VASP5.4.4，但是同样的方法编译VASP6.3的时候出问题，后来没折腾了

Weldingspock · 发表于 Post on 2023-6-1 21:23:26

JiangZiya 发表于 2023-5-31 22:08
我参考卢天老师的帖子用oneAPI编译过VASP5.4.4，但是同样的方法编译VASP6.3的时候出问题，后来没折腾了

不应该啊，oneapi编译vasp6.3非常简单？，你是报什么错

JiangZiya · 发表于 Post on 2023-6-4 18:27:58

Weldingspock 发表于 2023-6-1 21:23
不应该啊，oneapi编译vasp6.3非常简单？，你是报什么错

已经不记得了，有半年多没折腾了，后来一直用的5.4.4，准备有时间再尝试

JUmao · 发表于 Post on 2023-7-18 18:30:00

本帖最后由 JUmao 于 2023-7-18 18:31 编辑

你好，我正在尝试编译，目前openmpi已经编译完成了，但是在编译vasp的时候遇到了问题，想要参考你的makefile.include文件，但是作为一名新用户我无法下载，可以的话方便将makefile.include文件发送到我的邮箱中吗，962933072@@qq.com

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