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[新手求助] 高斯计算单点能L801 L804报错问题

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使用CCSD(T)/cc-pvtz计算单点能报错,
如下所示,
PCMQM: There is more than one cavity, setting IComp=0.
Error on total polarization charges =  0.06888
SCF Done:  E(RHF) =  -1432.92974520     A.U. after   12 cycles
            NFock= 12  Conv=0.61D-08     -V/T= 2.0008
KE= 1.431754411466D+03 PE=-6.118278208422D+03 EE= 1.916389221833D+03
SMD-CDS (non-electrostatic) energy       (kcal/mol) =       6.22
(included in total energy above)
Leave Link  502 at Wed May 31 10:53:07 2023, MaxMem=   536870912 cpu:      1244.9
(Enter /data/home/liuzzgroup/g09/g09/l801.exe)
Windowed orbitals will be sorted by symmetry type.
ExpMin= 1.03D-01 ExpMax= 3.74D+05 ExpMxC= 1.18D+03 IAcc=3 IRadAn=         5 AccDes= 0.00D+00
HarFok:  IExCor=  205 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         5 IDoV=-2 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT= 12500011 ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
Largest valence mixing into a core orbital is  5.36D-04
Largest core mixing into a valence orbital is  8.79D-05
Range of M.O.s used for correlation:    19   438
NBasis=   438 NAE=    62 NBE=    62 NFC=    18 NFV=     0
NROrb=    420 NOA=    44 NOB=    44 NVA=   376 NVB=   376
Leave Link  801 at Wed May 31 10:53:08 2023, MaxMem=   536870912 cpu:        22.4
(Enter /data/home/liuzzgroup/g09/g09/l804.exe)
Closed-shell transformation, MDV=   536870912 ITran=4 ISComp=1.
Semi-Direct transformation.
ModeAB=           4 MOrb=            44 LenV=     532500122
LASXX=   1522847491 LTotXX=  1522847491 LenRXX=  3056649871
LTotAB=  1533802380 MaxLAS=  1980039600 LenRXY=           0
NonZer=  4579497362 LenScr=  9194915328 LnRSAI=  1980039600
LnScr1=  2981709824 LExtra=           0 Total=  17213314623
MaxDsk=          -1 SrtSym=           T ITran=            4
DoSDTr:  NPSUse= 28
JobTyp=0 Pass  1:  I=   1 to  44.
Complete sort for first half transformation.
First half transformation complete.
Begin second half transformation for I=  10.
Erroneous write. Write -1 instead of 1355776.
fd = 4
orig len = 8384512 left = 1355776
g_write

输入文件如下
%nprocshared=28
%mem=4GB
%chk=C3F7SO3-2-C2-7-IRC-1-E.chk
#p ccsd(t)/cc-pvtz scrf=(smd,solvent=water) nosymm


C3F7SO3-2-C2-7-IRC-1-E


-2 1
C                 -2.05855100    0.31435000   -0.05854500
C                 -0.71337000   -0.38912500   -0.34797500
C                  0.50902900    0.51294500   -0.07535300
S                  2.09876700   -0.40643800    0.14705000
O                  3.08796800    0.65478800    0.05083600
O                  1.97729800   -1.00664500    1.46417600
O                  2.09499800   -1.34630800   -0.96347400
F                 -0.71324300   -0.74856800   -1.63776800
F                 -2.05509400    1.53651000   -0.58229500
F                 -0.65864600   -1.49070000    0.41005500
F                  0.64207400    1.35551400   -1.11212700
F                 -2.26740600    0.40562000    1.24578500
F                  0.27225900    1.24346200    1.02992000
F                 -3.04907800   -0.37610200   -0.60326300
H                 -3.33500200   -2.73923400    1.40927900
看了报错的解析帖子,加入了full,仍然报错

报错如下,
PCMQM: There is more than one cavity, setting IComp=0.
Error on total polarization charges =  0.06888
SCF Done:  E(RHF) =  -1432.92974520     A.U. after   12 cycles
            NFock= 12  Conv=0.61D-08     -V/T= 2.0008
KE= 1.431754411466D+03 PE=-6.118278208422D+03 EE= 1.916389221833D+03
SMD-CDS (non-electrostatic) energy       (kcal/mol) =       6.22
(included in total energy above)
Leave Link  502 at Wed May 31 11:43:20 2023, MaxMem=   536870912 cpu:      1274.5
(Enter /data/home/liuzzgroup/g09/g09/l801.exe)
Windowed orbitals will be sorted by symmetry type.
Range of M.O.s used for correlation:     1   438
NBasis=   438 NAE=    62 NBE=    62 NFC=     0 NFV=     0
NROrb=    438 NOA=    62 NOB=    62 NVA=   376 NVB=   376
Leave Link  801 at Wed May 31 11:43:21 2023, MaxMem=   536870912 cpu:         0.4
(Enter /data/home/liuzzgroup/g09/g09/l804.exe)
Closed-shell transformation, MDV=   536870912 ITran=4 ISComp=1.
Semi-Direct transformation.
ModeAB=           4 MOrb=            62 LenV=     532271288
LASXX=   2366132722 LTotXX=  2366132722 LenRXX=  4749606751
LTotAB=  2383474029 MaxLAS=  2909629620 LenRXY=           0
NonZer=  7115739473 LenScr= 14287292928 LnRSAI=  2909629620
LnScr1=  5842082816 LExtra=           0 Total=  27788612115
MaxDsk=          -1 SrtSym=           T ITran=            4
DoSDTr:  NPSUse= 28
JobTyp=0 Pass  1:  I=   1 to  62.
Complete sort for first half transformation.
Erroneous write. Write -1 instead of 1782749344.
fd = 4
orig len = 4248942120 left = 1782749344
g_write
输入文件如下
%nprocshared=28
%mem=4GB
%chk=C3F7SO3-2-C2-7-IRC-1-E.chk
#p ccsd(t,full)/cc-pvtz scrf=(smd,solvent=water) nosymm


C3F7SO3-2-C2-7-IRC-1-E


-2 1
C                 -2.05855100    0.31435000   -0.05854500
C                 -0.71337000   -0.38912500   -0.34797500
C                  0.50902900    0.51294500   -0.07535300
S                  2.09876700   -0.40643800    0.14705000
O                  3.08796800    0.65478800    0.05083600
O                  1.97729800   -1.00664500    1.46417600
O                  2.09499800   -1.34630800   -0.96347400
F                 -0.71324300   -0.74856800   -1.63776800
F                 -2.05509400    1.53651000   -0.58229500
F                 -0.65864600   -1.49070000    0.41005500
F                  0.64207400    1.35551400   -1.11212700
F                 -2.26740600    0.40562000    1.24578500
F                  0.27225900    1.24346200    1.02992000
F                 -3.04907800   -0.37610200   -0.60326300
H                 -3.33500200   -2.73923400    1.40927900

请教各位老师应该怎么修改才能正确计算呢


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发表于 Post on 2023-5-31 12:06:15 | 只看该作者 Only view this author
g_write是硬盘被写满了,要清理硬盘;不是说写个关键词再算一次 企图希望它不写满。当然,不排除你硬盘不够大,即使全清理了拿来算CCSD(T)也还不够用。

另外提醒一下,当前体系带-2负电荷,用cc-pVTZ计算没啥意义,基组一定要加弥散函数,可以给所有原子都用上弥散函数,也可以只给阴离子加上弥散函数。
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发表于 Post on 2023-6-1 05:01:38 | 只看该作者 Only view this author



此外,不要做出
%nprocshared=28
%mem=4GB
这么荒唐的设定,尤其还是高级别后HF计算,好好看下文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-2 09:18:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-1 05:01
此外,不要做出
%nprocshared=28
%mem=4GB

好的老师,我的内存设的太小了对叭,核数大的话,内存应该相应增大,
老师我这么算是可以是不

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-2 09:19:27 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-5-31 12:06
g_write是硬盘被写满了,要清理硬盘;不是说写个关键词再算一次 企图希望它不写满。当然,不排除你硬盘不够 ...

好的,谢谢老师,我再下去好好看看,对于阴离子,一定要加弥散函数吗

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发表于 Post on 2023-6-2 09:59:48 | 只看该作者 Only view this author
桃子量子 发表于 2023-6-2 09:19
好的,谢谢老师,我再下去好好看看,对于阴离子,一定要加弥散函数吗

一定
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-2 10:25:05 | 只看该作者 Only view this author

计算的时候加上弥散函数,是不是就不可以使用CCSD(T)/cc-pvtz计算单点能了呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-2 10:28:38 | 只看该作者 Only view this author

加上aug-,是不是就可以了呢,使用ccsd算单点能,
这样的话计算时间会大大增加,如果不使用CCSD去计算,请教是否还有别的基组可以代替呢

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发表于 Post on 2023-6-2 10:42:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-6-2 11:00 编辑
桃子量子 发表于 2023-6-2 10:28
加上aug-,是不是就可以了呢,使用ccsd算单点能,
这样的话计算时间会大大增加,如果不使用CCSD去计算, ...

我看你在一开始提问时讲的是CCSD(T),现在咋又说CCSD,方法名称要严谨,一个字符都不能漏。

可以用aug-cc-pVTZ,还可以降低弥散函数的使用量,见http://sobereva.com/119。另外,在2L已经说过了,可以只给涉及阴离子的原子加上弥散函数。

如果嫌慢,可以换用ORCA做DLPNO-CCSD(T)计算,可以使用与高斯中一样的基组。顺带一提,不要回复我说目前只能用高斯(因为这句话不成立,ORCA是免费程序,谁都可以下载使用)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-2 10:54:14 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-6-2 10:42
我看你在一开始提问时讲的是CCSD(T),现在咋又说CCSD,方法名称要严谨,一个字符都不能漏。

可以用aug ...

抱歉老师,不严谨了,好的谢谢老师

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