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[虚拟机] Win下安装linux系统后高斯同时运行数目变少

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台式机,在win下分出一个单独的硬盘(分配内存4G,硬盘50G),用centos和VMware安装了Linux系统,但是安装后发现在win下同时运行高斯计算的任务书大大减少(任务,关键词等都一样的情况下,比如原来可以同时运行10个任务,现在只能运行5个甚至更少),请教各位老师这个情况和安装Linux有关吗?还是其他原因造成的?

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发表于 Post on 2023-8-17 08:56:16 | 只看该作者 Only view this author
几个问题,首先,你原来的电脑是多大内存的?核心数也要说清楚。毕竟你只给虚拟机分配了4 G内存。然后,你说原来可以运行N个任务,你说的是在win版本的高斯下跑的么?最后,虽然说可能性不大,毕竟你也没给很多资源来算,但是有些高精度的算法,确实对于实施存储要求很高,比如CCSD(T),虽然限制了内存使用,但是大量的数据存储和抹去也会占用大量内存。所以最好把你的gjf文件放上来。
最可能的原因就是上面几个。
谢谢你,贾一乐。原来绕远路才是最短的捷径!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-17 09:30:20 | 只看该作者 Only view this author
钠离子电池 发表于 2023-8-17 08:56
几个问题,首先,你原来的电脑是多大内存的?核心数也要说清楚。毕竟你只给虚拟机分配了4 G内存。然后,你 ...

感谢老师解答。1.设备型号处理器是Intel(R) Core(TM) i9-10900K CPU @ 3.70GHz   3.70 GHz,机带RAM 32G。64位。   2.一直都是win下跑的高斯。 3.算的任务基本上就是四五十个CHON原子的有机化合物,优化用的基组一般都是B3LYP/6-311g**。请问在这种情况下,有可能是装虚拟机造成的吗?还是我在不知道的情况下,失误修改了win下或高斯软件里面的某些参数造成的?

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发表于 Post on 2023-8-17 11:23:55 | 只看该作者 Only view this author
虚拟机本来就会占用原有的系统资源。

打个比方,原来整个抽屉可以放10本书,现在你把抽屉做了个小隔断,只在这个小隔断里放书。你觉得这个小隔断里放到书会比原本一整个抽屉放的书一样多吗?

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计算化学公社外门弟子

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发表于 Post on 2023-8-17 11:54:23 | 只看该作者 Only view this author
不如直接给虚拟机分配 70%~80% 的内存,平常算直接在虚拟机里算,速度比 win 快得多。不用的时候关了就行了,不过关了也会占一点点内存。
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
Research interests: theoretical and computational chemistry and machine learning

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-17 14:55:13 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-8-17 11:23
虚拟机本来就会占用原有的系统资源。

打个比方,原来整个抽屉可以放10本书,现在你把抽屉做了个小隔断, ...

收到,感谢老师的解答

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-17 14:56:12 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-8-17 11:54
不如直接给虚拟机分配 70%~80% 的内存,平常算直接在虚拟机里算,速度比 win 快得多。不用的时候关了就行了 ...

收到,感谢老师的解答,学着试一下

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发表于 Post on 2023-8-18 05:11:29 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian全都在Linux虚拟机下跑就完了,本身核多的时候就比Windows下跑明显更快(哪怕考虑到虚拟机性能损失的情况下)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-18 14:55:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-18 05:11
Gaussian全都在Linux虚拟机下跑就完了,本身核多的时候就比Windows下跑明显更快(哪怕考虑到虚拟机性能损失 ...

谢谢老师解答,我这个是win版本的高斯,能在虚拟机的linux下运行吗?

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发表于 Post on 2023-8-18 15:31:05 | 只看该作者 Only view this author
jingetiema6112 发表于 2023-8-18 14:55
谢谢老师解答,我这个是win版本的高斯,能在虚拟机的linux下运行吗?

显然不行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-18 15:43:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jingetiema6112 于 2023-8-18 15:45 编辑

谢谢老师解答,还有3个问题,1.像我这个台式机,处理器是Intel(R) Core(TM) i9-10900K CPU @ 3.70GHz   3.70 GHz,机带RAM 32G。64位。如果跑一个任务,%mem= 和%nprocshared最大能设置多少?(高斯是win 64 单机版的)
2.如果有多个任务,一个一个任务依次跑快?还是多个任务同时提交运行更快?
3.如果一个个依次跑,有没有一种方法,使高斯算完一个后接着算另一个,不用再手动操作?

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发表于 Post on 2023-8-18 15:48:07 | 只看该作者 Only view this author
jingetiema6112 发表于 2023-8-18 15:43
谢谢老师解答,还有3个问题,1.像我这个台式机,处理器是Intel(R) Core(TM) i9-10900K CPU @ 3.70GHz   3 ...

1、2 该说的都说了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html

2 参考北京科音基础量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)的ppt:


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-18 15:58:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-18 15:48
1、2 该说的都说了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439(http://bbs.keins ...

好的卢老师,感谢您的详细解答。

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