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[新手求助] 计算Sc的水合离子的键能的问题

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楼主
各位老师好
  请教各位老师,我想计算Sc的水合离子的键能,第一次算,之前没算过,我刚使用了multiwfn计算了其laplace键级,我想通过计算得到Sc和水的结合力大于其他金属离子和水的结合力,通过计算键级和键能能说明结合力的问题嘛,请各位老师指教,感恩不尽。

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Sc水合离子的最后一帧结构

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发表于 Post on 2023-9-24 04:40:07 | 只看该作者 Only view this author
那是Laplacian键级而不是Laplace键级
当前情况不适合用键级来说明。直接算配体解离能进行对比就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-24 15:51:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-24 04:40
那是Laplacian键级而不是Laplace键级
当前情况不适合用键级来说明。直接算配体解离能进行对比就完了

谢谢老师的纠正和回复,老师,那我就是计算配位水分子的解离能,是嘛?请问老师,如果计算解离能怎么计算呀,老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-24 16:08:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-24 04:40
那是Laplacian键级而不是Laplace键级
当前情况不适合用键级来说明。直接算配体解离能进行对比就完了

老师,我的体系是Sc和水合离子上的O发生断裂,我是不是要计算Sc-O的键解离能,通过查阅您之前的帖子回复内容,您之前回复的“键解离能是整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都要分别优化”,我上传的文件相当于是做了整体优化,您说的断键后的两个片段,我不能很好的理解,针对我的体系,我断键后的体系就是Sc离子和配位水分子,那我是不是要在分别优化Sc离子和配位水分子,我的配位水分子有10个,我在计算的时候是删除Sc离子,单独优化这10个水分子,还是只断开一个水分子,优化这一个水分子和剩余片段分子的结构,计算设置的基组和泛函是不是应该都要同一水平下优化?

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发表于 Post on 2023-9-25 01:55:23 | 只看该作者 Only view this author
KYJY 发表于 2023-9-24 16:08
老师,我的体系是Sc和水合离子上的O发生断裂,我是不是要计算Sc-O的键解离能,通过查阅您之前的帖子回复 ...

断裂后的片段是指一个水分子,和一个少了一个配位水的Sc的水合离子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-25 11:05:57 | 只看该作者 Only view this author
老师,您可以帮我看下我片段的输入文件基组和泛函输入有没有问题,我的疑惑点在水分子基组和泛函的写法“# opt=loose genecp scrf empiricaldispersion=gd3 pbe1pbe/6-31G*”有没有问题?感谢老师的回复

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-25 16:18:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-25 01:55
断裂后的片段是指一个水分子,和一个少了一个配位水的Sc的水合离子

老师,我分别opt了片段的结构,没有做freq,请问老师,计算键的解离能在哪里读取电子能量和焓值呀,感谢老师的回复,第一次算键解离能,读取能量数值,有些迷糊,请老师指点,感恩不尽

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发表于 Post on 2023-9-26 03:07:32 | 只看该作者 Only view this author
KYJY 发表于 2023-9-25 11:05
老师,您可以帮我看下我片段的输入文件基组和泛函输入有没有问题,我的疑惑点在水分子基组和泛函的写法“#  ...

都写了6-31G*哪能再写genecp
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KYJY 发表于 2023-9-25 16:18
老师,我分别opt了片段的结构,没有做freq,请问老师,计算键的解离能在哪里读取电子能量和焓值呀,感谢 ...

使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 20:12:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-26 03:07
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552(http://bbs.kein ...

谢谢老师的回复,我在查看下

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